RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 MT-CO1P00395 513 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 CTSLP07711 333 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 GGCXP38435 758 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 CLDN2P57739 230 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 KCNMA1Q12791 1236 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 SLC12A1Q13621 1099 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF542PQ5EBM4 170 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 FBXL22Q6P050 247 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 OR13H1Q8NG92 308 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 OR4C6Q8NH72 309 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 COX16Q9P0S2 106 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 OR51B4Q9Y5P0 310 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 U3KQA8 63 aa13.78□□□□□ -0.2
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1W2PQU0 124 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 J3QKU1 62 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 K7ERQ8 282 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 USP12O75317 370 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CKMT1AP12532 417 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 KRT10P13645 584 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF18P17022 549 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 NUDT1P36639 197 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 GABREP78334 506 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SULT2A1Q06520 285 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 LY6DQ14210 128 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 KIF26BQ2KJY2 2108 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF284Q2VY69 593 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 FAM46CQ5VWP2 391 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ISM2Q6H9L7 571 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 BEND5Q7L4P6 421 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 DSG4Q86SJ6 1040 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 C14orf80Q86SX3 495 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ARRDC3Q96B67 414 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 APOLD1Q96LR9 279 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CALN1Q9BXU9 219 aa13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 TRPM6Q9BX84 2022 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 TCAF2A6NFQ2 919 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ERVH48-1M5A8F1 160 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 PMM2O15305 246 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SART1O43290 800 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CSO75390 466 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 PIAS2O75928 621 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 NEBLO76041 1014 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ACADSBP45954 432 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 AUHQ13825 339 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM110Q86TL2 294 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 EHBP1Q8NDI1 1231 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 PREBQ9HCU5 417 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ASCL3Q9NQ33 180 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 DDIT4Q9NX09 232 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 VANGL2Q9ULK5 521 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CASC3O15234 703 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SNAP91O60641 907 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 GRAP2O75791 330 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CNTN5O94779 1100 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SRCP12931 536 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 KRT5P13647 590 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 LSSP48449 732 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC63Q05C16 580 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 RABGAP1LQ5R372 815 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 OR6B2Q6IFH4 312 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 DEFB106AQ8N104 65 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 CHST14Q8NCH0 376 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 OR2A12Q8NGT7 310 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 STK32AQ8WU08 396 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF606Q8WXB4 792 aa13.75□□□□□ -0.21
TTPAL-203ENST00000372906 RNF34Q969K3 372 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms