RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 DRD3P35462 400 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP1A2P50993 1020 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 VAMP7P51809 220 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CNTN1Q12860 1018 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NNTQ13423 1086 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PTK2BQ14289 1009 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NCAPHQ15003 741 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A14Q15043 492 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 STK38Q15208 465 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00303Q3SY05 128 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM131CQ96AQ9 280 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX58Q96C10 678 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 E7ENQ6 273 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FPGTO14772 594 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MCF2LO15068 1137 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ZW10O43264 779 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO21O94952 628 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NR3C1P04150 777 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PRNPP04156 253 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NEFLP07196 543 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA6P08133 673 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT10P13645 584 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CD19P15391 556 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 JUNDP17535 347 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB6P18564 788 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2H1P32780 548 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 BLKP51451 505 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT83P78385 493 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NFKB2Q00653 900 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SGCGQ13326 291 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 STILQ15468 1287 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 AGBL4Q5VU57 503 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT39Q6A163 491 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 GUSBP11Q6P575 273 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 BORAQ6PGQ7 559 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZSR6 202 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CHSY1Q86X52 802 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13H1Q8NG92 308 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 LMX1AQ8TE12 382 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FEM1CQ96JP0 617 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPER2Q96P56 530 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CMKLR1Q99788 373 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOCQ99972 504 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CISHQ9NSE2 258 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC1Q9NV70 894 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN13Q12923 2485 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MUSKO15146 869 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 BNIP3LO60238 219 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NEBLO76041 1014 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-27P01718 113 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 LTFP02788 710 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT7P0C024 238 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A3P11169 496 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 LCP1P13796 627 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PRLRP16471 622 aa8.08□□□□□ -1.12
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