RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 STILQ15468 1287 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 CES4AQ5XG92 561 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 DCDC5Q6ZRR9 648 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 MCF2L2Q86YR7 1114 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 KCTD4Q8WVF5 259 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ADI1Q9BV57 179 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 EHD1Q9H4M9 534 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 H3BNX3 289 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ADORA2BP29275 332 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 EPHX2P34913 555 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ZNF423Q2M1K9 1284 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 TBCCD1Q9NVR7 557 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 SQORQ9Y6N5 450 aa16.56■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 DDHD2O94830 711 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 C2P06681 752 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ADRA2BP18089 450 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PCLAFQ15004 111 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PLD3Q8IV08 490 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PGAM4Q8N0Y7 254 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 CERS5Q8N5B7 392 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 RNF149Q8NC42 400 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 NGLY1Q96IV0 654 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 RNF157Q96PX1 679 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 BAIAP3O94812 1187 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 AMHR2Q16671 573 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ZBED5Q49AG3 693 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 CALML6Q8TD86 181 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 AGAP2Q99490 1192 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 TRIM15Q9C019 465 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 RNF19AQ9NV58 838 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 CAPN15O75808 1086 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 CSHL1Q14406 222 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 EMC2Q15006 297 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 OR9I1Q8NGQ6 314 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 HIPK3Q9H422 1215 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 CNTN3Q9P232 1028 aa16.55■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PSMB9P28065 219 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ITKQ08881 620 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PRKAA1Q13131 559 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 NOMO1Q15155 1222 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 MAPRE2Q15555 327 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 TEX44Q53QW1 395 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PLD5Q8N7P1 536 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 POC5Q8NA72 575 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 OR6B3Q8NGW1 331 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 COA1Q9GZY4 146 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 HMG20AQ9NP66 347 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 SYBUQ9NX95 663 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 FETUBQ9UGM5 382 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 BBOX1O75936 387 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ATP6V1B2P21281 511 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PSMB4P28070 264 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 EMP3P54852 163 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 WNT7BP56706 349 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 GSTM4Q03013 218 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ZNF460Q14592 562 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 URGCPQ8TCY9 931 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ZNF778Q96MU6 729 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 TCF12Q99081 682 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 PTPRJQ12913 1337 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 H3BNH8 94 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ASNA1O43681 348 aa16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
GPC1-201ENST00000264039 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms