RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ecrg4Q99LS0 148 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sytl1Q99N80 567 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ergic2Q9CR89 377 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Marc1Q9CW42 340 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 IscuQ9D7P6 168 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 TcimQ9D915 106 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Maged2Q9ER67 616 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pard6bQ9JK83 371 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa7.17□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Col24a1Q30D77 1733 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 4930469K13RikA0A286YDB2 92 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Card9A2AIV8 536 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Syndig1A2ANU3 258 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 D3Z070 196 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3164L7N2B9 238 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3264L7N2C5 238 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 KlO35082 1014 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fzd1O70421 642 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smpd2O70572 419 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 AvilO88398 819 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 GfapP03995 430 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nkx2-5P42582 318 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Echdc2Q3TLP5 296 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rufy4Q3TYX8 563 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q3UE31 404 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp560Q3URI6 754 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nkain3Q3URJ8 181 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fnip1Q68FD7 1165 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gpsm1Q6IR34 673 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ppp1r14dQ7TT52 146 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cpped1Q8BFS6 312 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fbxw21Q8BI38 468 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Galnt5Q8C102 930 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 ClmnQ8C5W0 1052 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dclre1bQ8C7W7 541 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mbtps2Q8CHX6 515 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Glra3Q91XP5 464 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ferd3lQ923Z4 168 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Xpo6Q924Z6 1125 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kdelr1Q99JH8 212 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Clca1Q9D7Z6 913 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tcirg1Q9JHF5 834 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 AireQ9Z0E3 552 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Oas1eA0A0J9YV76 386 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mup6A2AV72 179 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Armt1A6H630 439 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Apol7bB1AQP7 369 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem265E9Q8G3 109 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tex16F6WNY1 1150 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp212G3X8R7 492 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Spin2fJ3QPU0 254 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 PdynO35417 248 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cdk14O35495 469 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Casp8O89110 480 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 EgfP01132 1217 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Krt4P07744 525 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cd247P24161 164 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rad51Q08297 339 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Bpifb5Q3UQ05 490 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Apol7eQ3UZ24 369 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Has1Q61647 583 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pdcd4Q61823 469 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ptk6Q64434 451 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prl3a1Q78Y73 227 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ube2q1Q7TSS2 422 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pcdh19Q80TF3 1145 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf569Q80W31 679 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc9a4Q8BUE1 797 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rasal3Q8C2K5 1041 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 N4bp2l2Q8JZS6 575 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 IntS13Q8QZV7 732 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Map4k3Q99JP0 894 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rdh14Q9ERI6 334 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smok2bQ9QYZ3 484 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smok2aQ9QYZ6 504 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Krt6bQ9Z331 562 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2-BlV9GXR0 257 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dock1Q8BUR4 1865 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Col2a1P28481 1487 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r27D3YUK6 857 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm4847G3X946 537 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3532M0QWL4 194 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Casq2O09161 415 aa7.16□□□□□ -1.26
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc23O35125 340 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.2 ms