RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589216.1

PTPN2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2, human

TSL 3

Gene PTPN2, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN2-208	ENST00000589216	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	TMEM131	Q92545	1883 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216		A0A087X0T9	212 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF217	O75362	1048 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	LRIG2	O94898	1065 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	MOCS3	O95396	460 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	MT-CO1	P00395	513 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF806	P0C7X5	589 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	FAM228B	P0C875	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	CD6	P30203	668 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ACSL1	P33121	698 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ST8SIA6	P61647	398 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ZBED6	P86452	979 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SCAP	Q12770	1279 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SEMA3B	Q13214	749 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	MTA1	Q13330	715 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SLC12A1	Q13621	1099 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	LINGO4	Q6UY18	593 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216		Q6ZVU0	165 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	TMC6	Q7Z403	805 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	NLRP14	Q86W24	1093 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	STK40	Q8N2I9	435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	KDM1B	Q8NB78	822 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PTPRN2	Q92932	1015 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	NTAN1	Q96AB6	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	C1orf74	Q96LT6	269 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	CNPY3	Q9BT09	278 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	GPR174	Q9BXC1	333 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	MUC3B	Q9H195	1237 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	VPS45	Q9NRW7	570 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	RNF103	O00237	685 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PLK4	O00444	970 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	MID1	O15344	667 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ZMPSTE24	O75844	475 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	GZMA	P12544	262 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SRC	P12931	536 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	TCF4	P15884	667 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	MAOB	P27338	520 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	OR1E1	P30953	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ACVRL1	P37023	503 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ID4	P47928	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PSMD8	P48556	350 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ARF5	P84085	180 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ZNF33A	Q06730	810 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	CST6	Q15828	149 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	CA9	Q16790	459 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	LRRC31	Q6UY01	552 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	VSTM4	Q8IW00	320 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	FAM129B	Q96TA1	746 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	EDEM2	Q9BV94	578 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	SARDH	Q9UL12	918 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPN2-208	ENST00000589216	FZD10	Q9ULW2	581 aa		10.12	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms