RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNK3	O14649	394 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CACNG3	O60359	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TLR5	O60602	858 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CLEC3A	O75596	197 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BEST1	O76090	585 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SYP	P08247	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CISD3	P0C7P0	127 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NCAM1	P13591	858 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC130	P13994	396 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TYR	P14679	529 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SCP2	P22307	547 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GJB2	P29033	226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CD6	P30203	668 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	UBA7	P41226	1012 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DPP6	P42658	865 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IL12RB1	P42701	662 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PDE6C	P51160	858 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	COPA	P53621	1224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RBP5	P82980	135 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IL9R	Q01113	521 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BBS2	Q9BXC9	721 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1B0GTW7	788 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		A8MXQ7	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC26A4	O43511	780 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NDUFS2	O75306	463 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF217	O75362	1048 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TACC1	O75410	805 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TNNC2	P02585	160 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PRKCH	P24723	683 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	YWHAQ	P27348	245 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MATK	P42679	507 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ABCG1	P45844	678 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CASP4	P49662	377 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TPMT	P51580	245 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MFAP3	P55082	362 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CDH8	P55286	799 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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