RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PPC4 97 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 F8VZ95 297 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 CNTN5O94779 1100 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 F9P00740 461 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF18P17022 549 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 CDH4P55283 916 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 C21orf59P57076 290 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 NAA35Q5VZE5 725 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 RHBDD1Q8TEB9 315 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 FRS2Q8WU20 508 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 ALG14Q96F25 216 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 SLC6A18Q96N87 628 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 SPAG5Q96R06 1193 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 BNIP3LO60238 219 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 GFPT2O94808 682 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 RHOCP08134 193 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 SCNN1AP37088 669 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 KLK7P49862 253 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 KRT31Q15323 416 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC31Q6UY01 552 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRBP23467 1997 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 USP24Q9UPU5 2620 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 FRYQ5TBA9 3013 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3EA0A087X179 549 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3LB9A6J9 549 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 PLK4O00444 970 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 FLRT2O43155 660 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 CBFA2T3O75081 653 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3HP0C7X1 549 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 FLT3P36888 993 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 ADPRHP54922 357 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 DLG2Q15700 870 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 C5orf22Q49AR2 442 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 ALFQ53S48 1182 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 GATA6Q92908 595 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 NT5C3BQ969T7 300 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 GBP4Q96PP9 640 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 GANQ9H2C0 597 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP4C-211ENST00000567642 H0Y8X5 98 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 I6L893 689 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 ATP9BO43861 1147 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 CCT8P50990 548 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 METAP1P53582 386 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 NOMO3P69849 1222 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 KRT83P78385 493 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 Q6ZVU0 165 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 GPT2Q8TD30 523 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 SKA1Q96BD8 255 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 EBF2Q9HAK2 575 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 FANCLQ9NW38 375 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 MPP6Q9NZW5 540 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms