RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 NUP58Q9BVL2 599 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 VPS28Q9UK41 221 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 C4orf47A7E2U8 309 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 K7ERQ8 282 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 TM4SF5O14894 197 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 MID1O15344 667 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 CCP110O43303 1012 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 DNTTP04053 509 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 RHOCP08134 193 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 SDHBP21912 280 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 GLDCP23378 1020 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 OXTRP30559 389 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 PRKCIP41743 596 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 METAP1P53582 386 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 LIMK1P53667 647 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 OXCT1P55809 520 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 TPM4P67936 248 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 MANEALQ5VSG8 457 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 STRADAQ7RTN6 431 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 OR7D4Q8NG98 312 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 RTKNQ9BST9 563 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 TRIM7Q9C029 511 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 MUC3BQ9H195 1237 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 FBRSQ9HAH7 460 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 IFNKQ9P0W0 207 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 NEU3Q9UQ49 428 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTA-216ENST00000560243 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 METTL12A8MUP2 240 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ATP9BO43861 1147 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ENGP17813 658 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 OR1E1P30953 314 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 MAPK8P45983 427 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 PSMD8P48556 350 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ZBTB16Q05516 673 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 SULT2A1Q06520 285 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 MAMLD1Q13495 774 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 DLG2Q15700 870 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 CST6Q15828 149 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ACCSLQ4AC99 568 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 FIGNQ5HY92 759 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 HGSNATQ68CP4 663 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 LINGO4Q6UY18 593 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 Q6ZVU0 165 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 DRC7Q8IY82 874 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 AADATQ8N5Z0 425 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 GANCQ8TET4 914 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 CAPN10Q9HC96 672 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 TMEM51Q9NW97 253 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 FBXL12Q9NXK8 326 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 VPS51Q9UID3 782 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 A0A1W2PP55 124 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 MEI4A8MW99 385 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 PLK4O00444 970 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ZMPSTE24O75844 475 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 LRIG2O94898 1065 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 SEMA4FO95754 770 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 SERPINF2P08697 491 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 SRCP12931 536 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 SLC8A1P32418 973 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 HOXD12P35452 270 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 NNMTP40261 264 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 IL31Q6EBC2 164 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTA-216ENST00000560243 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms