RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 SPOPO43791 374 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 EXTL3O43909 919 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GCATO75600 419 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 RRM1P23921 792 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ETV4P43268 484 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 EPHB1P54762 984 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TSPY1Q01534 308 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 LBX2Q6XYB7 198 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 WWP1Q9H0M0 922 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PORCNQ9H237 461 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SEPT3Q9UH03 358 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PPME1Q9Y570 386 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 AP4S1Q9Y587 144 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PTPRJQ12913 1337 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ADM5C9JUS6 153 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 H0YCG3 227 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 K7ERI5 159 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ERBB2P04626 1255 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ATF2P15336 505 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 IL32P24001 234 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TTKP33981 857 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GCNT1Q02742 428 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GNA12Q03113 381 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RALGDSQ12967 914 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DPYSQ14117 519 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 LLGL1Q15334 1064 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SEZ6Q53EL9 994 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C2CD6Q53TS8 623 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NXNQ6DKJ4 435 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 HIPK4Q8NE63 616 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MZB1Q8WU39 189 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TXNDC15Q96J42 360 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CNTN3Q9P232 1028 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 EDN1P05305 212 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ICAM3P32942 547 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 HPCAL1P37235 193 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NR4A2P43354 598 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 HPS6Q86YV9 775 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FBXW8Q8N3Y1 598 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 VPS35Q96QK1 796 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF347Q96SE7 839 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf50Q9BV19 199 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FBXO40Q9UH90 709 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CSADQ9Y600 493 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GIPC1O14908 333 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FSCN2O14926 492 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GRIN3BO60391 1043 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ATG7O95352 703 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 HLA-DRAP01903 254 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MAN1A1P33908 653 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 IDUAP35475 653 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NAMPTP43490 491 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZACNQ401N2 412 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.64□□□□□ -1.03
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