RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490668.5

SFPQ-210, Transcript of splicing factor proline and glutamine rich, humanhuman

TSL 2

Gene SFPQ, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFPQ-210ENST00000490668 FAM155BO75949 473 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 AKAP3O75969 853 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 TNFRSF6BO95407 300 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 TPM2P07951 284 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 KITP10721 976 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 ODC1P11926 461 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 JUPP14923 745 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 PAMP19021 973 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 AOAHP28039 575 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 BRCC3P46736 316 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 9.6
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SFPQ-210ENST00000490668 NDUFV1P49821 464 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 MXI1P50539 228 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 HK3P52790 923 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 LGALS4P56470 323 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 STX17P56962 302 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 TNNC1P63316 161 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 RBP5P82980 135 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 PRR20EP86478 221 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 PRR20CP86479 221 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 PRR20DP86480 221 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 PRR20BP86481 221 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 PRR20AP86496 221 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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SFPQ-210ENST00000490668 PTPRJQ12913 1337 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 MYO1EQ12965 1108 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 EFR3AQ14156 821 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 ADGRE1Q14246 886 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 ERV3-1Q14264 604 aa4.59□□□□□ -1.67
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SFPQ-210ENST00000490668 PTPN14Q15678 1187 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 ZBTB6Q15916 424 aa4.59□□□□□ -1.67
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SFPQ-210ENST00000490668 USP41Q3LFD5 358 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 FIGNQ5HY92 759 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 CFAP58Q5T655 872 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.59□□□□□ -1.67
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SFPQ-210ENST00000490668 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 APPL2Q8NEU8 664 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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SFPQ-210ENST00000490668 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 TTPALQ9BTX7 342 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 HDAC8Q9BY41 377 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.59□□□□□ -1.67
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SFPQ-210ENST00000490668 INTS13Q9NVM9 706 aa4.59□□□□□ -1.67
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SFPQ-210ENST00000490668 CLDND1Q9NY35 253 aa4.59□□□□□ -1.67
SFPQ-210ENST00000490668 DSEQ9UL01 958 aa4.59□□□□□ -1.67
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SFPQ-210ENST00000490668 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.58□□□□□ -1.68
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SFPQ-210ENST00000490668 SYCE3A1L190 88 aa4.58□□□□□ -1.68
SFPQ-210ENST00000490668 KPNA7A9QM74 516 aa4.58□□□□□ -1.68
SFPQ-210ENST00000490668 H7C0S8 307 aa4.58□□□□□ -1.68
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SFPQ-210ENST00000490668 GLUD1P00367 558 aa4.58□□□□□ -1.68
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SFPQ-210ENST00000490668 TRIM49CP0CI26 452 aa4.58□□□□□ -1.68
SFPQ-210ENST00000490668 BMP4P12644 408 aa4.58□□□□□ -1.68
SFPQ-210ENST00000490668 P4HA1P13674 534 aa4.58□□□□□ -1.68
SFPQ-210ENST00000490668 BRAFP15056 766 aa4.58□□□□□ -1.68
SFPQ-210ENST00000490668 VAV1P15498 845 aa4.58□□□□□ -1.68
SFPQ-210ENST00000490668 DNAJB1P25685 340 aa4.58□□□□□ -1.68
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