RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	MIPEP	Q99797	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-210	ENST00000486388	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HCRT	O43612	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CACNG3	O60359	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DFNA5	O60443	496 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TLR5	O60602	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CDK4	P11802	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NCAM1	P13591	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62	6e-6	■■■□□ 18.9
UBP1-210	ENST00000486388	HNF1B	P35680	557 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GRK6	P43250	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	AP3M2	P53677	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC5A3	P53794	718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CDH8	P55286	799 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZXDB	P98169	803 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GRIK2	Q13002	908 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BIRC3	Q13489	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SNX19	Q92543	992 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GABRG3	Q99928	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PTPRD	P23468	1912 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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