RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 RINLQ6ZS11 566 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 RFX8Q6ZV50 586 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 GPSM1Q86YR5 675 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TMEM199Q8N511 208 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 FSIP1Q8NA03 581 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 KLQ9UEF7 1012 aa7.46□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 PIP5K1CO60331 668 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 KLRC2P26717 231 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 AVPR2P30518 371 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CHRNA5P30532 468 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 STAT1P42224 750 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 GXYLT1Q4G148 440 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 THAP4Q8WY91 577 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 Q9N2J8 555 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.45□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 B4DGG1 531 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SYN3O14994 580 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TFRCP02786 760 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 GSTM2P28161 218 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 HALP42357 657 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP10-11P60412 298 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SEMA3AQ14563 771 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ALG10Q5BKT4 473 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 LINS1Q8NG48 757 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 FEM1BQ9UK73 627 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.44□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 RXRAP19793 462 aa7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 OAZ1P54368 228 aa7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 PPATQ06203 517 aa7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 PTGR1Q14914 329 aa7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TWIST1Q15672 202 aa7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 THAP1Q9NVV9 213 aa7.43□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SCP2P22307 547 aa7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CYP2J2P51589 502 aa7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 LINC00205P59089 165 aa7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SPATA5Q8NB90 893 aa7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 FZD3Q9NPG1 666 aa7.42□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 MYMKA6NI61 221 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 STX16O14662 325 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SEPT4O43236 478 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 NTN1O95631 604 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TOMM40O96008 361 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TK1P04183 234 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CYP4B1P13584 511 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ARSAP15289 507 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 PNPLA4P41247 253 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ACTR2P61160 394 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 HIPK3Q9H422 1215 aa7.41□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CD8B2A6NJW9 211 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 H0YGN5 161 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 FCGR2AP12318 317 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SLC16A2P36021 539 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 PLK5Q496M5 336 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 AAGABQ6PD74 315 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 INPP5DQ92835 1189 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 DERAQ9Y315 318 aa7.4□□□□□ -1.22
SGCE-210ENST00000472326 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 LCKP06239 509 aa7.39□□□□□ -1.23
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