RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 CHST9Q7L1S5 443 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 PID1Q7Z2X4 250 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 HDXQ7Z353 690 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF567Q8N184 647 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 USP33Q8TEY7 942 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 BHMTQ93088 406 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 SP110Q9HB58 689 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 E2F8A0AVK6 867 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 NEBLO76041 1014 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 PRAMEF12O95522 483 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 RHOCP08134 193 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 FSHRP23945 695 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 CHKAP35790 457 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF33AQ06730 810 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 CASP8Q14790 479 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 PARP15Q460N3 678 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.97■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 E7EVH7 732 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 H0Y626 953 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 METTL18O95568 372 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 JCHAINP01591 159 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 NUMBP49757 651 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB17Q13105 803 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 GPR149Q86SP6 731 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 DDI1Q8WTU0 396 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 AGAP3Q96P47 875 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 MATN3O15232 486 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 PAPLNO95428 1278 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 CCNB1P14635 433 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ACVRL1P37023 503 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 LMAN1P49257 510 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 GNA12Q03113 381 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 ANO4Q32M45 955 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 HOOK3Q86VS8 718 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 CPXM2Q8N436 756 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 PWWP2AQ96N64 755 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 VAT1Q99536 393 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 CDH22Q9UJ99 828 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-204ENST00000402096 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 FDFT1P37268 417 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 TEX44Q53QW1 395 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 IL31Q6EBC2 164 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 SPON2Q9BUD6 331 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 FUT8Q9BYC5 575 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 MAGEH1Q9H213 219 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 LAMA3Q16787 3333 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 A0A0D9SEW6 157 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 J3KR12 359 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 CHADO15335 359 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 CYBBP04839 570 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 APRTP07741 180 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 PSMB4P28070 264 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 SERINC3Q13530 473 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 CDH18Q13634 790 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 KCNJ11Q14654 390 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 SLMAPQ14BN4 828 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF77Q15935 545 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 MPPE1Q53F39 396 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 POTEHQ6S545 545 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms