RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CACNG3O60359 315 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 RASSF2P50749 326 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CDH17Q12864 832 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 NUP93Q8N1F7 819 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CNTD1Q8N815 330 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 USP33Q8TEY7 942 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 C8orf48Q96LL4 319 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 APOL2Q9BQE5 337 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SAR1AQ9NR31 198 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 UBP1Q9NZI7 540 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1W2PQY0 241 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CHUKO15111 745 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJB2P25686 324 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 INPP5DQ92835 1189 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.19■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SYN3O14994 580 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 T-ENOLP0DO92 83 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TYK2P29597 1187 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TUBP50607 506 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 OCRLQ01968 901 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 DDR2Q16832 855 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 INSCQ1MX18 579 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MFSD3Q96ES6 412 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 RBBP8Q99708 897 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 OSER1Q9NX31 292 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SOX13Q9UN79 622 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 NUP205Q92621 2012 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MATN3O15232 486 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJC6O75061 913 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 NOD2Q9HC29 1040 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 HS3ST4Q9Y661 456 aa22.18■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 E9PAM4 449 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MAFKO60675 156 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CBX6O95503 412 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MYL2P10916 166 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 COL6A1P12109 1028 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TPH1P17752 444 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 IRX4P78413 519 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ZBTB16Q05516 673 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 C16orf46Q6P387 395 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM237Q96Q45 408 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 FCRL5Q96RD9 977 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 IL12RB2Q99665 862 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 EMCNQ9ULC0 261 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.17■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 PLIN3O60664 434 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SERPINB3P29508 390 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 GPR15P49685 360 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 LIMK2P53671 638 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 STX3Q13277 289 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ARTNQ5T4W7 220 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CES4AQ5XG92 561 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 KCNMB4Q86W47 210 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SKA1Q96BD8 255 aa22.16■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 C1orf74Q96LT6 269 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms