RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 URGCPQ8TCY9 931 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 HIC2Q96JB3 615 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 LRGUKQ96M69 825 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SYT17Q9BSW7 474 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 Q9H521 79 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 AKT3Q9Y243 479 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CREB3O43889 395 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 AMHP03971 560 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SCNN1AP37088 669 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CCR10P46092 362 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ITGA7Q13683 1181 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 GK3PQ14409 553 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PID1Q7Z2X4 250 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TMEM135Q86UB9 458 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RNF139Q8WU17 664 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 OXSMQ9NWU1 459 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PTTG2Q9NZH5 202 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 VPS28Q9UK41 221 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 HES2Q9Y543 173 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.23■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TSPAN1O60635 241 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CYP2C8P10632 490 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 EPHA3P29320 983 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RPL34P49207 117 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SULT1E1P49888 294 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MYBPC1Q00872 1141 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MS4A2Q01362 244 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PDK1Q15118 436 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 NADK2Q4G0N4 442 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 LILRA2Q8N149 483 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RCN3Q96D15 328 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CNBD2Q96M20 576 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PHF24Q9UPV7 400 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 HDAC3O15379 428 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 DPP6P42658 865 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 BCAT1P54687 386 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PKNOX1P55347 436 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CEACAM7Q14002 265 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ZFP1Q6P2D0 407 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 DEFB106AQ8N104 65 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ADAM32Q8TC27 787 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MFSD3Q96ES6 412 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ZNF385DQ9H6B1 395 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RAP2CQ9Y3L5 183 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SCN4AP35499 1836 aa15.22■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 KCNK1O00180 336 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 GRID2O43424 1007 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MATKP42679 507 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RPL14P50914 215 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 UNC93AQ86WB7 457 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 AHI1Q8N157 1196 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 DRC3Q9H069 523 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 APPL1Q9UKG1 709 aa15.21■□□□□ 0.03
SYP-201ENST00000263233 TK2O00142 265 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CFLARO15519 480 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PDGFRBP09619 1106 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms