RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 FSCBQ5H9T9 825 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CFAP157Q5JU67 520 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 HDAC11Q96DB2 347 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 VAT1Q99536 393 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 GBA3Q9H227 469 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 TREHO43280 583 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 HSPA4LO95757 839 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 DSG1Q02413 1049 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 GSTA3Q16772 222 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 URGCPQ8TCY9 931 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 MFSD3Q96ES6 412 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 IL22Q9GZX6 179 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM114B3SHH9 223 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ATP9BO43861 1147 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 F9P00740 461 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 SERPINB6P35237 376 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 GMPRP36959 345 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ERFP50548 548 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 EPGNQ6UW88 154 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CLEC14AQ86T13 490 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 KCNMB4Q86W47 210 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ACTRT2Q8TDY3 377 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CDH19Q9H159 772 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 COG4Q9H9E3 785 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 NMRAL1Q9HBL8 299 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 DDIT4Q9NX09 232 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 RRN3Q9NYV6 651 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 G3V2L1 256 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 I6L893 689 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 AP3B1O00203 1094 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PTGESO14684 152 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 TRIM13O60858 407 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 AP1G2O75843 785 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 MPP3Q13368 585 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 NPWQ8N729 165 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF781Q8N8C0 355 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 GATA6Q92908 595 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 AZIN2Q96A70 460 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 S100A14Q9HCY8 104 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 MID2Q9UJV3 735 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 C2P06681 752 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 USP17L7P0C7H9 530 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CRABP2P29373 138 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 HADHAP40939 763 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 LHX1P48742 406 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 TUBP50607 506 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 GALNT2Q10471 571 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 USP4Q13107 963 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PGM2L1Q6PCE3 622 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 SENP8Q96LD8 212 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 EPAS1Q99814 870 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 WDCPQ9H6R7 721 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 CDH22Q9UJ99 828 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 UPP2O95045 317 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 LTFP02788 710 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 NFKB1P19838 968 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PRDX6P30041 224 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 PSEN2P49810 448 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD3-201ENST00000249440 EPHB1P54762 984 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms