RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 VPS28Q9UK41 221 aa22.39■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 TRIM16O95361 564 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SYPP08247 313 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 MAOBP27338 520 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ZNF165P49910 485 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CDH4P55283 916 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 C14orf80Q86SX3 495 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SCML1Q9UN30 329 aa22.38■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 GJB3O75712 270 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SDC4P31431 198 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ATP11AP98196 1134 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ARID5BQ14865 1188 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ARCQ7LC44 396 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 FAM131BQ86XD5 332 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 EMC1Q8N766 993 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 FASNP49327 2511 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 METTL12A8MUP2 240 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SEMA4FO95754 770 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CALB1P05937 261 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ACSL1P33121 698 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 IRAK1P51617 712 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 PLK1P53350 603 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CST6Q15828 149 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CDO1Q16878 200 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ACCSLQ4AC99 568 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 OMDQ99983 421 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SGK2Q9HBY8 427 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CKAP5Q14008 2032 aa22.36■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 A0A1B0GTW7 788 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SRGAP2O75044 1071 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 RHOCP08134 193 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 FERP16591 822 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 PSMD8P48556 350 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 USP30Q70CQ3 517 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 C1orf74Q96LT6 269 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 HAPLN3Q96S86 360 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 AGPAT1Q99943 283 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.35■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 LAMA5O15230 3695 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ANKRD62A6NC57 917 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 E9PAM4 449 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 MID1O15344 667 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SH3BP5O60239 455 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 CNTN5O94779 1100 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 KRT3P12035 628 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 TPM4P67936 248 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 KRT83P78385 493 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 SLC14A1Q13336 389 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 C5orf22Q49AR2 442 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 TRNP1Q6NT89 227 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 STK40Q8N2I9 435 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 LHX6Q9UPM6 363 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.33■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 TAF4O00268 1085 aa22.33■■□□□ 1.17
NME4-201ENST00000219479 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms