RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptpn9O35239 593 aa22.22■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gucy1b3O54865 620 aa22.22■■□□□ 1.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GkQ64516 559 aa22.22■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Best2Q8BGM5 508 aa22.22■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 C8bQ8BH35 589 aa22.22■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PigtQ8BXQ2 582 aa22.22■■□□□ 1.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Unc45aQ99KD5 944 aa22.22■■□□□ 1.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptpn13Q64512 2453 aa22.22■■□□□ 1.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sptbn2Q68FG2 2388 aa22.21■■□□□ 1.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp3a13Q64464 503 aa22.21■■□□□ 1.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Camta2Q80Y50 1208 aa22.21■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc16Q8C1F5 767 aa22.21■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa22.21■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa22.21■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trps1Q925H1 1281 aa22.21■■□□□ 1.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ift43Q9DA69 206 aa22.21■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Htra2Q9JIY5 458 aa22.21■■□□□ 1.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Csnk1eQ9JMK2 416 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Igkv7-33P01632 114 aa22.2■■□□□ 1.14
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FshrP35378 692 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tgif1P70284 272 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Meis3P97368 378 aa22.2■■□□□ 1.14
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hvcn1Q3U2S8 269 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Naf1Q3UMQ8 489 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Erich4Q3UNU4 136 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm527Q4KL13 310 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tfap2bQ61313 459 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dusp23Q6NT99 150 aa22.2■■□□□ 1.14
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snx7Q9CY18 387 aa22.2■■□□□ 1.14
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cfap57Q9D180 1249 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sertad3Q9ERC3 197 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rtn3Q9ES97 964 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fiz1Q9WTJ4 500 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pck1Q9Z2V4 622 aa22.2■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scn8aQ9WTU3 1978 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AlpiF8VPQ6 554 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 H2-Q8P14430 326 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sipa1P46062 1037 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem237Q3V0J1 427 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Txndc8Q69AB2 127 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prpf39Q8K2Z2 665 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arfgap2Q99K28 520 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Thap12Q9CUX1 758 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mgrn1Q9D074 532 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ankrd7Q9D504 279 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wdr5bQ9D7H2 328 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem225Q9D9S2 230 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd302Q9DCG2 228 aa22.19■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mta2Q9R190 668 aa22.19■■□□□ 1.14
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc191J3QQ27 883 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Krt35Q497I4 455 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Methig1Q76I26 264 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il17cQ8K4C5 194 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wdr98Q8VC42 657 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arl13aQ9D416 372 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmub1Q9JMG3 245 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbn2Q61555 2907 aa22.18■■□□□ 1.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm28729A0A1B0GSW2 409 aa22.17■■□□□ 1.14
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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