Protein–RNA interactions for Protein: Q69AB2

Txndc8, Thioredoxin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc8Q69AB2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Txndc8Q69AB2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Txndc8Q69AB2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Txndc8Q69AB2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Txndc8Q69AB2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Txndc8Q69AB2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Txndc8Q69AB2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Txndc8Q69AB2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Txndc8Q69AB2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Txndc8Q69AB2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Txndc8Q69AB2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Txndc8Q69AB2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Txndc8Q69AB2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Txndc8Q69AB2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Txndc8Q69AB2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Txndc8Q69AB2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Txndc8Q69AB2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Txndc8Q69AB2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Txndc8Q69AB2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Txndc8Q69AB2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Txndc8Q69AB2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Txndc8Q69AB2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Txndc8Q69AB2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Txndc8Q69AB2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Txndc8Q69AB2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Txndc8Q69AB2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Txndc8Q69AB2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Txndc8Q69AB2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Txndc8Q69AB2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Txndc8Q69AB2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Txndc8Q69AB2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Txndc8Q69AB2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Txndc8Q69AB2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Txndc8Q69AB2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Txndc8Q69AB2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Txndc8Q69AB2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Txndc8Q69AB2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Txndc8Q69AB2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Txndc8Q69AB2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Txndc8Q69AB2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Txndc8Q69AB2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Txndc8Q69AB2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Txndc8Q69AB2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Txndc8Q69AB2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Txndc8Q69AB2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Txndc8Q69AB2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Txndc8Q69AB2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Txndc8Q69AB2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Txndc8Q69AB2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Txndc8Q69AB2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Txndc8Q69AB2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Txndc8Q69AB2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Txndc8Q69AB2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Txndc8Q69AB2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Txndc8Q69AB2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Txndc8Q69AB2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Txndc8Q69AB2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Txndc8Q69AB2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Txndc8Q69AB2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Txndc8Q69AB2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Txndc8Q69AB2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Txndc8Q69AB2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Txndc8Q69AB2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Txndc8Q69AB2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Txndc8Q69AB2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Txndc8Q69AB2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Txndc8Q69AB2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Txndc8Q69AB2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Txndc8Q69AB2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Txndc8Q69AB2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Txndc8Q69AB2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Txndc8Q69AB2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Txndc8Q69AB2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Txndc8Q69AB2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Txndc8Q69AB2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Txndc8Q69AB2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Txndc8Q69AB2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Txndc8Q69AB2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Txndc8Q69AB2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Txndc8Q69AB2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Txndc8Q69AB2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Txndc8Q69AB2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Txndc8Q69AB2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Txndc8Q69AB2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Txndc8Q69AB2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Txndc8Q69AB2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Txndc8Q69AB2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Txndc8Q69AB2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Txndc8Q69AB2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Txndc8Q69AB2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Txndc8Q69AB2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Txndc8Q69AB2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Txndc8Q69AB2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Txndc8Q69AB2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Txndc8Q69AB2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Txndc8Q69AB2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Txndc8Q69AB2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Txndc8Q69AB2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Txndc8Q69AB2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Txndc8Q69AB2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms