RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Smpdl3aP70158 445 aa5.96□□□□□ -1.45
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kctd13Q8BGV7 329 aa5.96□□□□□ -1.45
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spag16Q8K450 639 aa5.96□□□□□ -1.45
Herc1-201ENSMUST00000042824 4930558K02RikE0CXC6 182 aa5.96□□□□□ -1.45
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm5415E9PXF3 478 aa5.96□□□□□ -1.45
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rassf5Q5EBH1 413 aa5.96□□□□□ -1.45
Herc1-201ENSMUST00000042824 Txndc8Q69AB2 127 aa5.96□□□□□ -1.45
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vps26bQ8C0E2 336 aa5.96□□□□□ -1.45
Herc1-201ENSMUST00000042824 NuggcD3YWJ0 796 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3252E9PUT9 216 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3468E9QAJ8 216 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pcdhb16Q91Y03 802 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Wdsub1Q9D0I6 474 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Krtap5-3Q9D226 196 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Col2a1P28481 1487 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spag17Q5S003 2320 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 C87414E9PWI7 475 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ptpn9O35239 593 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 UgcgO88693 394 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tbc1d1Q60949 1255 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bcap29Q61334 240 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Styk1Q6J9G1 429 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trit1Q80UN9 467 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc20a2Q80UP8 656 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atp2c2A7L9Z8 944 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nr3c1P06537 783 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Krt80Q0VBK2 452 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 SnphQ80U23 495 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clcn5Q9WVD4 746 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r70K7N702 854 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Has3O08650 554 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mtnd2P03893 345 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 AmhP27106 555 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mtnr1aQ61184 353 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mbtd1Q6P5G3 631 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1037Q7TR84 321 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mtmr14Q8VEL2 648 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ogfod2Q9CQ04 349 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lztr1Q9CQ33 837 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tll2Q9WVM6 1012 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atg16l2Q6KAU8 623 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc44a2Q8BY89 706 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Map4k3Q99JP0 894 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nphs1Q9QZS7 1256 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cdk14O35495 469 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 H2afxP27661 143 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Scarf1Q5ND28 820 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tas2r102Q7M717 329 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 LnpkQ7TQ95 425 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 LppQ8BFW7 613 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 NlnQ91YP2 704 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nsmce3Q9CPR8 279 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trip4Q9QXN3 581 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Padi3Q9Z184 664 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Galnt3P70419 633 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpsm1Q6IR34 673 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 HaghlQ9DB32 283 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cul3Q9JLV5 768 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mta2Q9R190 668 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp990B1AVN5 605 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm2956E9PVJ0 216 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3002E9PW72 216 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp607bG3X9H3 648 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm8108K7N734 216 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3739L7N296 216 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3164L7N2B9 238 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3488M0QW81 238 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pde8aO88502 823 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cul4aQ3TCH7 759 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sco1Q5SUC9 284 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lrrc42Q8R2U7 421 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr695Q8VFM3 315 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 AcadsbQ9DBL1 432 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Htatip2Q9Z2G9 242 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm6685D3YYP3 228 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fnip2Q80TD3 1108 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem202Q80W35 275 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trim14Q8BVW3 440 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bri3bpQ8BXV2 253 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tssk3Q9D2E1 268 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam174aQ9D3L0 190 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Oma1Q9D8H7 521 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Oxct2bQ9ESL0 520 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Oxct2aQ9JJN4 520 aa5.96□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atp2c1Q80XR2 918 aa5.95□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 AA792892Q8C6S1 278 aa5.95□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hormad1Q9D5T7 392 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms