RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf518bB2RRE4 1077 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd2P08920 344 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prf1P10820 554 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptpn1P35821 432 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 S100bP50114 92 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TubP50586 505 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Timm13P62075 95 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Htr1aQ64264 421 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mvb12bQ6KAU4 317 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Shkbp1Q6P7W2 704 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr299Q7TS05 330 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf473Q8BI67 892 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ttc24Q8BYG0 334 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam204aQ8C6C7 236 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Barhl2Q8VIB5 384 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 B3galt6Q91Z92 325 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9CPS8 106 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Noxred1Q9D3S5 366 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AuhQ9JLZ3 314 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slfn2Q9Z0I6 378 aa20.21■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trbv4A0A075B5I2 113 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lcn6A2AJB9 181 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r67K7N6T2 851 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc26a1P58735 704 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SkiQ60698 725 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fnip1Q68FD7 1165 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DgkqQ6P5E8 934 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aph1bQ8C7N7 257 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LipmQ8K2A6 422 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Msi2Q920Q6 346 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tlr9Q9EQU3 1032 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rsc1a1Q9ER99 582 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpinb3cA2RSF9 386 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm11236J3QMS7 360 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm7942L7N277 499 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Axin1O35625 863 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C1qbpO35658 278 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt10P02535 570 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc2a7P0C6A1 513 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Glt6d1Q2NKH9 311 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wee2Q66JT0 555 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dpy19l3Q71B07 716 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr20Q7TRX9 314 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpc2Q8BKV1 579 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmx4Q8C0L0 335 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dedd2Q8QZV0 330 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NcaldQ91X97 193 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Grk2Q99MK8 689 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acot13Q9CQR4 140 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plod1Q9R0E2 728 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ApipQ9WVQ5 241 aa20.2■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plxna3P70208 1872 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plin4O88492 1403 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rgsl1H3BL40 1073 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MycP01108 439 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Crabp2P22935 138 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klra4Q60651 263 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chsy1Q6ZQ11 800 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpr142Q7TQN9 365 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddhd1Q80YA3 547 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lysmd3Q99LE3 305 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem115Q9WUH1 350 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 M1apQ9Z0E1 529 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nlrc5C3VPR6 1915 aa20.19■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp985A2A7A5 519 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 E2f6O54917 272 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HcrtO55241 130 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmb4P99026 264 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PapolaQ61183 739 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MafkQ61827 156 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ankrd6Q69ZU8 712 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr538Q7TRT5 310 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hdac7Q8C2B3 938 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acad10Q8K370 1069 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt2b1Q8R084 529 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lars2Q8VDC0 902 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DdoQ922Z0 341 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atad3Q925I1 591 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdkn2aipnlQ9D211 116 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sept5Q9Z2Q6 369 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm14496K7N5U4 849 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oas1aP11928 367 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PenkP22005 268 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fut7Q11131 389 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oas1gQ8K469 367 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SarafQ8R3Q0 334 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr348Q8VGK3 313 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prkag2Q91WG5 566 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo32Q9CPU7 355 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms