Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR4

Acot13, Acyl-coenzyme A thioesterase 13, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot13Q9CQR4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,82■■■■□ 3,48
Acot13Q9CQR4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Acot13Q9CQR4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Acot13Q9CQR4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Acot13Q9CQR4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Acot13Q9CQR4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Acot13Q9CQR4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,75■■■□□ 2,83
Acot13Q9CQR4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Acot13Q9CQR4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,29■■■□□ 2,76
Acot13Q9CQR4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Acot13Q9CQR4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Acot13Q9CQR4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Acot13Q9CQR4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Acot13Q9CQR4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,65
Acot13Q9CQR4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Acot13Q9CQR4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Acot13Q9CQR4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Acot13Q9CQR4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Acot13Q9CQR4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Acot13Q9CQR4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Acot13Q9CQR4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Acot13Q9CQR4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Acot13Q9CQR4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Acot13Q9CQR4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Acot13Q9CQR4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Acot13Q9CQR4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Acot13Q9CQR4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Acot13Q9CQR4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Acot13Q9CQR4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Acot13Q9CQR4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Acot13Q9CQR4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Acot13Q9CQR4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Acot13Q9CQR4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Acot13Q9CQR4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Acot13Q9CQR4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Acot13Q9CQR4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Acot13Q9CQR4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Acot13Q9CQR4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Acot13Q9CQR4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Acot13Q9CQR4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Acot13Q9CQR4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Acot13Q9CQR4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Acot13Q9CQR4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Acot13Q9CQR4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Acot13Q9CQR4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Acot13Q9CQR4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Acot13Q9CQR4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Acot13Q9CQR4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Acot13Q9CQR4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Acot13Q9CQR4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Acot13Q9CQR4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Acot13Q9CQR4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Acot13Q9CQR4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Acot13Q9CQR4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Acot13Q9CQR4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Acot13Q9CQR4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Acot13Q9CQR4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Acot13Q9CQR4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Acot13Q9CQR4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Acot13Q9CQR4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Acot13Q9CQR4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Acot13Q9CQR4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Acot13Q9CQR4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Acot13Q9CQR4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Acot13Q9CQR4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Acot13Q9CQR4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Acot13Q9CQR4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Acot13Q9CQR4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Acot13Q9CQR4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Acot13Q9CQR4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Acot13Q9CQR4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Acot13Q9CQR4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Acot13Q9CQR4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Acot13Q9CQR4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Acot13Q9CQR4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Acot13Q9CQR4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Acot13Q9CQR4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Acot13Q9CQR4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Acot13Q9CQR4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Acot13Q9CQR4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Acot13Q9CQR4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Acot13Q9CQR4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Acot13Q9CQR4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Acot13Q9CQR4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Acot13Q9CQR4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Acot13Q9CQR4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Acot13Q9CQR4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Acot13Q9CQR4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Acot13Q9CQR4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Acot13Q9CQR4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Acot13Q9CQR4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Acot13Q9CQR4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Acot13Q9CQR4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Acot13Q9CQR4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Acot13Q9CQR4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Acot13Q9CQR4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Acot13Q9CQR4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Acot13Q9CQR4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Acot13Q9CQR4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Acot13Q9CQR4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms