Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR4

Acot13, Acyl-coenzyme A thioesterase 13, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot13Q9CQR4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Acot13Q9CQR4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Acot13Q9CQR4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Acot13Q9CQR4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Acot13Q9CQR4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Acot13Q9CQR4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Acot13Q9CQR4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Acot13Q9CQR4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Acot13Q9CQR4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Acot13Q9CQR4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Acot13Q9CQR4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Acot13Q9CQR4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Acot13Q9CQR4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Acot13Q9CQR4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Acot13Q9CQR4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Acot13Q9CQR4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Acot13Q9CQR4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Acot13Q9CQR4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Acot13Q9CQR4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Acot13Q9CQR4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Acot13Q9CQR4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Acot13Q9CQR4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Acot13Q9CQR4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Acot13Q9CQR4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Acot13Q9CQR4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Acot13Q9CQR4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Acot13Q9CQR4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Acot13Q9CQR4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Acot13Q9CQR4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Acot13Q9CQR4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Acot13Q9CQR4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Acot13Q9CQR4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Acot13Q9CQR4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Acot13Q9CQR4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Acot13Q9CQR4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Acot13Q9CQR4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Acot13Q9CQR4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Acot13Q9CQR4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Acot13Q9CQR4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Acot13Q9CQR4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Acot13Q9CQR4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Acot13Q9CQR4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Acot13Q9CQR4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Acot13Q9CQR4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Acot13Q9CQR4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Acot13Q9CQR4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Acot13Q9CQR4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Acot13Q9CQR4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Acot13Q9CQR4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Acot13Q9CQR4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Acot13Q9CQR4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Acot13Q9CQR4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Acot13Q9CQR4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Acot13Q9CQR4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Acot13Q9CQR4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Acot13Q9CQR4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Acot13Q9CQR4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Acot13Q9CQR4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Acot13Q9CQR4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Acot13Q9CQR4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Acot13Q9CQR4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Acot13Q9CQR4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Acot13Q9CQR4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Acot13Q9CQR4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Acot13Q9CQR4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Acot13Q9CQR4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Acot13Q9CQR4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Acot13Q9CQR4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Acot13Q9CQR4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Acot13Q9CQR4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Acot13Q9CQR4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Acot13Q9CQR4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Acot13Q9CQR4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Acot13Q9CQR4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Acot13Q9CQR4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Acot13Q9CQR4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Acot13Q9CQR4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Acot13Q9CQR4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Acot13Q9CQR4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Acot13Q9CQR4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Acot13Q9CQR4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Acot13Q9CQR4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Acot13Q9CQR4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Acot13Q9CQR4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Acot13Q9CQR4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Acot13Q9CQR4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Acot13Q9CQR4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Acot13Q9CQR4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Acot13Q9CQR4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Acot13Q9CQR4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Acot13Q9CQR4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Acot13Q9CQR4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Acot13Q9CQR4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Acot13Q9CQR4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Acot13Q9CQR4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Acot13Q9CQR4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Acot13Q9CQR4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Acot13Q9CQR4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Acot13Q9CQR4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Acot13Q9CQR4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms