RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LINC00299Q6ZSB3 139 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CHSY3Q70JA7 882 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAM83AQ86UY5 434 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SNX32Q86XE0 403 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EMC1Q8N766 993 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRIML2Q8N7C3 387 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HIPK4Q8NE63 616 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CXorf38Q8TB03 319 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GIPC3Q8TF64 312 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HSPH1Q92598 858 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TFAP2CQ92754 450 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SPATA13Q96N96 652 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OR52B2Q96RD2 323 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RMDN3Q96TC7 470 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADPGKQ9BRR6 497 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CALN1Q9BXU9 219 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 COQ10BQ9H8M1 238 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WDR41Q9HAD4 459 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARMC1Q9NVT9 282 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OXSMQ9NWU1 459 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CD300AQ9UGN4 299 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FBXO40Q9UH90 709 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 APPL1Q9UKG1 709 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AP4S1Q9Y587 144 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CNTNAP1P78357 1384 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PARP14Q460N5 1801 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAGEB16A2A368 324 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WDR27A2RRH5 827 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FUOMA2VDF0 154 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UNCXA6NJT0 531 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C9IYK1 514 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DLGAP1O14490 977 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SOCS7O14512 581 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAGEB3O15480 346 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AKAP10O43572 662 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NPHS1O60500 1241 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SNAP91O60641 907 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CILPO75339 1184 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 E2F6O75461 281 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZMPSTE24O75844 475 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SULT1C4O75897 302 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IL18RAPO95256 599 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ESRRBO95718 433 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HSPA4LO95757 839 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TNNC2P02585 160 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OATP04181 439 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ASNSP08243 561 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PDGFRAP16234 1089 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms