RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565821.1

CYCSP39-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 39, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP39, Length 309 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP39-201ENST00000565821 NPTX2P47972 431 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 NDUFV1P49821 464 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SCNN1GP51170 649 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ZNF134P52741 427 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 RABGGTBP53611 331 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PRMT2P55345 433 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 OCA2Q04671 838 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TROAPQ12815 778 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TCF15Q12870 199 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ACVR2BQ13705 512 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 E2F2Q14209 437 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 KCNAB1Q14722 419 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 NECTIN1Q15223 517 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SHHQ15465 462 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TIGD6Q17RP2 521 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 LY6KQ17RY6 165 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CXCL17Q6UXB2 119 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CHST13Q8NET6 341 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CYP2W1Q8TAV3 490 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 POC1BQ8TC44 478 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 Q8TCH9 128 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SOCS4Q8WXH5 440 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SNX19Q92543 992 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 BADQ92934 168 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PIGSQ96S52 555 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 NEU1Q99519 415 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 NACAP1Q9BZK3 213 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 MAGEH1Q9H213 219 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 MROH8Q9H579 483 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 LY9Q9HBG7 655 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PARD6AQ9NPB6 346 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 FEM1BQ9UK73 627 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CCPG1Q9ULG6 757 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 HPSEQ9Y251 543 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 FRMPD3Q5JV73 1810 aa3.35□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PATE3B3GLJ2 98 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 NPC1O15118 1278 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 IRAK2O43187 625 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 STRNO43815 780 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SNX2O60749 519 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PRAMEF10O60809 474 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ZBED4O75132 1171 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 USP1O94782 785 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SUN1O94901 812 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 TNFRSF6BO95407 300 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 HSD3B1P14060 373 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 MYOGP15173 224 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CD6P30203 668 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CYP2C18P33260 490 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 SERPINF1P36955 418 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CDK7P50613 346 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 DGKEP52429 567 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 STAT2P52630 851 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 ACLYP53396 1101 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 CCNA1P78396 465 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 MC2RQ01718 297 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 MYO1EQ12965 1108 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PPFIA1Q13136 1202 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 DYRK1AQ13627 763 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 PTK2BQ14289 1009 aa3.34□□□□□ -1.87
CYCSP39-201ENST00000565821 KCTD2Q14681 263 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.3 ms