RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	TAS2R38	P59533	333 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ST8SIA6	P61647	398 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	NCOA4	Q13772	614 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	AGBL4	Q5VU57	503 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	MYOC	Q99972	504 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	UBE4B	O95155	1302 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	NBAS	A2RRP1	2371 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	PLD2	O14939	933 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CLIC2	O15247	247 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SLC7A4	O43246	635 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	PHACTR2	O75167	634 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	LATS1	O95835	1130 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	IL1B	P01584	269 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	PRLR	P16471	622 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	UGT1A5	P35504	534 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CLDN10	P78369	228 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	INCA1	Q0VD86	236 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	NCAPH	Q15003	741 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	DTX1	Q86Y01	620 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	KLK6	Q92876	244 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	KLF15	Q9UIH9	416 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298		A0A087X0B3	334 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SLC31A1	O15431	190 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	STX6	O43752	255 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	HGF	P14210	728 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CD97	P48960	835 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CYP2J2	P51589	502 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CLDN2	P57739	230 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	FRS2	Q8WU20	508 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	STIM2	Q9P246	746 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	RP1	P56715	2156 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CACNA1D	Q01668	2161 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	FBN2	P35556	2912 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	KIF20A	O95235	890 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	IGLV3-27	P01718	113 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	CSF2	P04141	144 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	RNF224	P0DH78	156 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	BIRC3	Q13489	604 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	FZD2	Q14332	565 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-208	ENST00000547298	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		11.65	□□□□□ -0.54

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