RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 RGS2P41220 211 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LBX1P52954 281 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ODF1Q14990 250 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LY6KQ17RY6 165 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 Q4G0T1 1027 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 NCAPH2Q6IBW4 605 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CHPFQ8IZ52 775 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ABRAQ8N0Z2 381 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SAMD3Q8N6K7 520 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TRIB2Q92519 343 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 EPSTI1Q96J88 318 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MBOAT7Q96N66 472 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MTMR9Q96QG7 549 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 IWS1Q96ST2 819 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF577Q9BSK1 485 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM17Q9Y577 477 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FRMPD4Q14CM0 1322 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 B4DLN1 442 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PROM1O43490 865 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 YEATS4O95619 227 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CCNE2O96020 404 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 HOXC6P09630 235 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 NPTX2P47972 431 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CYP4A11Q02928 519 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ACVR2BQ13705 512 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ATL3Q6DD88 541 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SHC4Q6S5L8 630 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC17AQ6ZS10 378 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PDILTQ8N807 584 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FSIP1Q8NA03 581 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 C3orf20Q8ND61 904 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TRPV1Q8NER1 839 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ETNPPLQ8TBG4 499 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 RAET1EQ8TD07 263 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ERO1AQ96HE7 468 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 UROC1Q96N76 676 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 UNC45AQ9H3U1 944 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 KCNMB3Q9NPA1 279 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA12Q9UN75 941 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 POLHQ9Y253 713 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 E7ENX8 843 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 E9PLN8 166 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PPP6R2O75170 966 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PEX14O75381 377 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PSMD10O75832 226 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MATN4O95460 622 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GGPS1O95749 300 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GJB1P08034 283 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 HOXD10P28358 340 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GRIA3P42263 894 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA8P51970 172 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 BEX3Q00994 111 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SETQ01105 290 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TNFAIP2Q03169 654 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TAP2Q03519 686 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 KARSQ15046 597 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM266Q2M3C6 531 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD14CQ5VZR4 134 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ADALQ6DHV7 355 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 XRRA1Q6P2D8 792 aa5.21□□□□□ -1.58
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