RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MAGEB16A2A368 324 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TLR5O60602 858 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRAMEF11O60813 436 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 EPOP01588 193 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CR2P20023 1033 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TACR2P21452 398 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CCNFP41002 786 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DBN1Q16643 649 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 KAZNQ674X7 775 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 KDELC1Q6UW63 502 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 IFT81Q8WYA0 676 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 YME1L1Q96TA2 773 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DPH5Q9H2P9 285 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TLR9Q9NR96 1032 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 VPS45Q9NRW7 570 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DPP7Q9UHL4 492 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SGK1O00141 431 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 METTL18O95568 372 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 IL1BP01584 269 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ETS1P14921 441 aa6.61□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 NPY2RP49146 381 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RABGGTBP53611 331 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 OXCT1P55809 520 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MPP3Q13368 585 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SNX1Q13596 522 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HIF1AQ16665 826 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ODF2Q5BJF6 829 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 EDEM1Q92611 657 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TTC17Q96AE7 1141 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC114Q96M63 670 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GDF15Q99988 308 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SENP1Q9P0U3 644 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FBXO10Q9UK96 956 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 KDELR3O43731 214 aa6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 NME3Q13232 169 aa6.6□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 OTUB2Q96DC9 234 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 B3GALT6Q96L58 329 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MGME1Q9BQP7 344 aa6.6□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 KIFC1Q9BW19 673 aa6.6□□□□□ -1.35
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