RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 NR2C1P13056 603 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GLULP15104 373 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF23P17027 643 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PIK3CGP48736 1102 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GATMP50440 423 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HSF2Q03933 536 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO43Q4G163 708 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RESP18Q5W5W9 173 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RAB12Q6IQ22 244 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SCYL2Q6P3W7 929 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PPM1NQ8N819 430 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ANKS1AQ92625 1134 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SNAPC3Q92966 411 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DCUN1D1Q96GG9 259 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ASB2Q96Q27 587 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 RAB34Q9BZG1 259 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SP110Q9HB58 689 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ARGFXA6NJG6 315 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TBX1O43435 398 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 B4GAT1O43505 415 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LPXNO60711 386 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CAMTA2O94983 1202 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CD2P06729 351 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GLI1P08151 1106 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ERVK-10P10266 1014 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DDCP20711 480 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RASA1P20936 1047 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CAPGP40121 348 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PRCPP42785 496 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NEK3P51956 506 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PRKAA2P54646 552 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 POU4F2Q12837 409 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BTBD16Q32M84 506 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZBED5Q49AG3 693 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RRM2BQ7LG56 351 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TPH2Q8IWU9 490 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA6LQ8N4H0 392 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FITM2Q8N6M3 262 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC185Q8N715 623 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NANPQ8TBE9 248 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DTD1Q8TEA8 209 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RMDN3Q96TC7 470 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EYA3Q99504 573 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB18Q99592 522 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PADI4Q9UM07 663 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ERGIC3Q9Y282 383 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 71.8
PTPRC-209ENST00000442510 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AIM2O14862 343 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GSC2O15499 205 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ALADP13716 330 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ACADLP28330 430 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TNFRSF8P28908 595 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN6P29350 595 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ERP29P30040 261 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINB9P50453 376 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ADCY7P51828 1080 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HK3P52790 923 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MMRN1Q13201 1228 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 STARD3Q14849 445 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NRF1Q16656 503 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SGO1Q5FBB7 561 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TAF2Q6P1X5 1199 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD7Q86VX2 200 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DDIASQ8IXT1 998 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 IQCKQ8N0W5 287 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RIT1Q92963 219 aa5.69□□□□□ -1.5
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