RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 RAD54BQ9Y620 910 aa12.92□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 EML5Q05BV3 1969 aa12.92□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 DOCK4Q8N1I0 1966 aa12.92□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 E9PAM4 449 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 PRPSAP2O60256 369 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 ATG13O75143 517 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 PALMO75781 387 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 TCF4P15884 667 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 IL1R2P27930 398 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 SLC1A1P43005 524 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 NHLH1Q02575 133 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 RABGAP1LQ5R372 815 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 MBLAC2Q68D91 279 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 C11orf63Q6NUN7 778 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 SYT13Q7L8C5 426 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 SLFN11Q7Z7L1 901 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 LRRC57Q8N9N7 239 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 HAPLN3Q96S86 360 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 KCNH6Q9H252 994 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 FBXO4Q9UKT5 387 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa12.91□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 DRGXA6NNA5 263 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 CSKP41240 450 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 IL12RB1P42701 662 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 TAS2R40P59535 323 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 ZNF234Q14588 700 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 CRY1Q16526 586 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 HADHQ16836 314 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 PTPRNQ16849 979 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 ARL13BQ3SXY8 428 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 C5orf22Q49AR2 442 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 CHPFQ8IZ52 775 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 ZNF366Q8N895 744 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 ACDQ96AP0 544 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 C1orf74Q96LT6 269 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 PEBP4Q96S96 227 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 ZWILCHQ9H900 591 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 KCND1Q9NSA2 647 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 OR12D3Q9UGF7 316 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 FZD10Q9ULW2 581 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.9□□□□□ -0.34
CNMD-201ENST00000377962 A0A1B0GVM2 712 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PQF6 199 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 TCAF2A6NFQ2 919 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 SPOPO43791 374 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 HLA-EP13747 358 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 TNNT1P13805 278 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 PRKCHP24723 683 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 NTSR1P30989 418 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 CA9Q16790 459 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 BOLA3Q53S33 107 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 PITRM1Q5JRX3 1037 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 ERMARDQ5T6L9 678 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 LRRC31Q6UY01 552 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 SYCE1Q8N0S2 351 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 AHI1Q8N157 1196 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 NELL1Q92832 810 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 NTAN1Q96AB6 310 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 SLC6A17Q9H1V8 727 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 MTG2Q9H4K7 406 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 NEU3Q9UQ49 428 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 INVSQ9Y283 1065 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 STON1Q9Y6Q2 735 aa12.89□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 FTCDO95954 541 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 RARAP10276 462 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 AIF1P55008 147 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 CDH4P55283 916 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 SCAPQ12770 1279 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 MTA1Q13330 715 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 SMTNL2Q2TAL5 461 aa12.88□□□□□ -0.35
CNMD-201ENST00000377962 ZNF528Q3MIS6 628 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms