RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364056.1

RNU6-960P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 960, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-960P, Length 120 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-960P-201ENST00000364056 FOXF2Q12947 444 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PGM5Q15124 567 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 FBXO43Q4G163 708 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 RUNDC3AQ59EK9 446 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 ATG16L1Q676U5 607 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 GALNT16Q8N428 558 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 ESX1Q8N693 406 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 NELL1Q92832 810 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 TBATAQ96M53 351 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 RASSF1Q9NS23 344 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PDP2Q9P2J9 529 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 HSF4Q9ULV5 492 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 C17orf100A8MU93 164 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 ADAM10O14672 748 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 SGPL1O95470 568 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 NFATC1O95644 943 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 WNT1P04628 370 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CD63P08962 238 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CYP4B1P13584 511 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 ATP1A3P13637 1013 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 KLRC2P26717 231 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 EPHB2P29323 1055 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 TYK2P29597 1187 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 MCM2P49736 904 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 RPS6KA3P51812 740 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 GHRHRQ02643 423 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 TRPC3Q13507 836 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 SEMA3AQ14563 771 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 HTRA1Q92743 480 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 KAT2BQ92831 832 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 MROH8Q9H579 483 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 Q9N2J8 555 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 HDAC6Q9UBN7 1215 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 A0A1B0GVC2 190 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 A0A1W2PPC1 479 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM90A7PA6NKC0 464 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 A6NLC8 198 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNJ18B7U540 433 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 MASP2O00187 686 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 BCAR3O75815 825 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CELA2AP08217 269 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 WEE2P0C1S8 567 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PRR35P0CG20 571 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CTSAP10619 480 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 FCGR2AP12318 317 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PRKCHP24723 683 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CIITAP33076 1130 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 HNF1BP35680 557 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PGM1P36871 562 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 PTPN9P43378 593 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 HSF1Q00613 529 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 RHAGQ02094 409 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-960P-201ENST00000364056 CFHR1Q03591 330 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms