RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF195O14628 629 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 ZBTB17Q13105 803 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 GPR142Q7Z601 462 aa25.91■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 NDE1Q9NXR1 346 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 IPPQ9Y573 584 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 RNF111Q6ZNA4 994 aa25.91■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 CUL3Q13618 768 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 STXBP5Q5T5C0 1151 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 FRMD7Q6ZUT3 714 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 NCAM1P13591 858 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 TPI1P60174 286 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 SV2CQ496J9 727 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 CPNE1Q99829 537 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 TINF2Q9BSI4 451 aa25.9■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 LPCAT4Q643R3 524 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 HPS6Q86YV9 775 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 DEFB107AQ8IZN7 70 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 DDIT4Q9NX09 232 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 SHROOM3Q8TF72 1996 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
HOXB3-201ENST00000311626 KLHL2O95198 593 aa25.89■■□□□ 1.73
HOXB3-201ENST00000311626 CHRNGP07510 517 aa25.89■■□□□ 1.73
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