RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hddc2Q3SXD3 199 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 InipQ3TXT3 104 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm1587Q3UT80 123 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Scaf8Q6DID3 1268 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 WtipQ7TQJ8 398 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zbtb41Q811F1 908 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem221Q8K071 230 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gsg1Q8R1W2 324 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc35c2Q8VCX2 364 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pgam1Q9DBJ1 254 aa20.14■□□□□ 0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CitP49025 2055 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 KlO35082 1014 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DdcO88533 480 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Soat2O88908 525 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DesP31001 469 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prox1P48437 737 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Morf4l1P60762 362 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Faf2Q3TDN2 445 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nol9Q3TZX8 714 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rab26Q504M8 260 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nudt16Q6P3D0 195 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DgkqQ6P5E8 934 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TufmQ8BFR5 452 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mapkap1Q8BKH7 522 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fnbp1lQ8K012 605 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 FdpsQ920E5 353 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cnot11Q9CWN7 505 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Upk1aQ9D132 257 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trem1Q9JKE2 230 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tbk1Q9WUN2 729 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 IsxA1A546 240 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mkrn2osD3Z393 217 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Neurog2P70447 263 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NxnP97346 435 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mcm9Q2KHI9 1134 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prom2Q3UUY6 835 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lgr6Q3UVD5 967 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CochQ62507 552 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc154Q6RUT8 657 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sox11Q7M6Y2 395 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Baiap2l2Q80Y61 522 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Best2Q8BGM5 508 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anapc2Q8BZQ7 837 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 HnmtQ91VF2 295 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 St7Q99M96 577 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PmpcbQ9CXT8 489 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tbx20Q9ES03 445 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abcb5B5X0E4 1255 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pagr1bF6V0H0 108 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Shmt1P50431 478 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccr1P51675 355 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Clec4fP70194 548 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Htr4P97288 388 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ebf1Q07802 591 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc16a9Q7TM99 508 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sel1l3Q80TS8 1137 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Asb14Q8C6Y6 587 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc29a1Q9JIM1 460 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tle2Q9WVB2 767 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SmoktcrA2KF29 484 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ThbdP15306 577 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CstaP56567 97 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp953Q3UPV7 304 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Scn2bQ56A07 215 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Afap1l1Q8BZI0 768 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mospd1Q8VEL0 213 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim8Q99PJ2 551 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hmgn3Q9DCB1 99 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CercamA3KGW5 592 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PrkcbP68404 671 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrfn1Q2WF71 766 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q32M26 199 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cep295nlQ497N6 533 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam160a1Q505K2 1081 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc184Q8BMK5 191 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pggt1bQ8BUY9 377 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bri3bpQ8BXV2 253 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Snrnp25Q8VIK1 123 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cab39lQ9DB16 337 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc86Q9JJ89 426 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arl10Q9QXJ4 243 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm6205E9PZS2 359 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ShdO88834 343 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Msr1P30204 458 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.7 ms