RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	FOL1	P53848	824 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	ISU1	Q03020	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	SPO20	Q04359	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	FUI1	P38196	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	ERP2	P39704	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	ADI1	Q03677	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	CIT1	P00890	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	SFP1	P32432	683 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	MRP8	P35719	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	YKL069W	P36088	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	UGO1	Q03327	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	SHE9	Q04172	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	ADR1	P07248	1323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	FLP1	P03870	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	KIP2	P28743	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	NTG2	Q08214	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	TAF13	P11747	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	VMA3	P25515	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	LDH1	P38139	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	YBR287W	P38355	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	CAN1	P04817	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	AGP1	P25376	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	ERP6	P53198	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	SLX4	Q12098	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	SCT1	P32784	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	DYS1	P38791	387 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	PMT3	P47190	753 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	FMP25	Q08023	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	FBP26	P32604	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	HAP5	Q02516	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	YBR184W	P38299	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	IRR1	P40541	1150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP12	YJL197W	FIR1	P40020	876 aa		4.59	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PSY2	P40164	858 aa		4.59	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	RRN7	P40992	514 aa		4.59	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	EEB1	Q02891	456 aa		4.59	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	MOD5	P07884	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	RGD2	P43556	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ENT3	P47160	408 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ATG16	Q03818	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	COG4	Q06096	861 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	GCR1	P07261	785 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	BAS1	P22035	811 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PIC2	P40035	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	YGR021W	P53212	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ULP1	Q02724	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	GEM1	P39722	662 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	TMA17	Q12513	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	HUL4	P40985	892 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	WSC3	Q12215	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	CDC11	P32458	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	STE5	P32917	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PBY1	P38254	753 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	YGR237C	P50089	785 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	WTM2	Q12206	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	HLJ1	P48353	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	GNP1	P48813	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	TAF8	Q03750	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ESC2	Q06340	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	STE6	P12866	1290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SEC61	P32915	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	BNI4	P53858	892 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	TFB2	Q02939	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ULI1	P43604	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ATG13	Q06628	738 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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