RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	SLA1	P32790	1244 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	MOD5	P07884	428 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	SCJ1	P25303	377 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	YGL082W	P53155	381 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	HED1	Q03937	162 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	CDC16	P09798	840 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	BRN1	P38170	754 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	NPR2	P39923	615 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	CSN12	P47130	423 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	PKH1	Q03407	766 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	PHM7	Q12252	991 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	ALR1	Q08269	859 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YCK1	YHR135C	KIN1	P13185	1064 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	PCT1	P13259	424 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	DLD1	P32891	587 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	YJL181W	P46987	611 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	RPA14	P50106	137 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	MDG1	P53885	366 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	RMD1	Q03441	430 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	PSH1	Q12161	406 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	RLF2	Q12495	606 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	HXT13	P39924	564 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	ITC1	P53125	1264 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	GCR2	Q01722	534 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	ESS1	P22696	170 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	HXT17	P53631	564 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	YMR074C	Q04773	145 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	NYV1	Q12255	253 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	PDR18	P53756	1333 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	CDC4	P07834	779 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	NCB2	Q92317	146 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	PMD1	P32634	1753 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	YPR097W	Q06839	1073 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	YDL206W	Q12424	762 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	MRPS35	P53292	345 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	UBP16	Q02863	499 aa		7.29	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	DJP1	P40564	432 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	YGL242C	P53066	181 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YCK1	YHR135C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	CLA4	P48562	842 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	MLC1	P53141	149 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	MTC5	Q03897	1148 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	RIM20	Q12033	661 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	YJU3	P28321	313 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	PIB2	P53191	635 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	PUS5	Q06244	254 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	CTI6	Q08923	506 aa		7.27	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	SRS2	P12954	1174 aa		7.26	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	BUG1	Q12191	341 aa		7.26	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	SAC3	P46674	1301 aa		7.26	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	UBP1	P25037	809 aa		7.25	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	KIP2	P28743	706 aa		7.24	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	BRE2	P43132	505 aa		7.24	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	CTH1	P47976	325 aa		7.24	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	YNL193W	P53870	558 aa		7.24	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	HAT1	Q12341	374 aa		7.24	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	RSC30	P38781	883 aa		7.23	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	NPA3	P47122	385 aa		7.23	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	HST3	P53687	447 aa		7.23	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	ADR1	P07248	1323 aa		7.22	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	HKR1	P41809	1802 aa		7.21	□□□□□ -1.25
YCK1	YHR135C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	CWH41	P53008	833 aa		7.21	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	VPS20	Q04272	221 aa		7.21	□□□□□ -1.26
YCK1	YHR135C	AFT1	P22149	690 aa		7.2	□□□□□ -1.26

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