RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 USP32Q8NFA0 1604 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 EVC2Q86UK5 1308 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 IDI1Q13907 227 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 MFRPQ9BY79 579 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF521Q96K83 1311 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 SEMA3EO15041 775 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-208ENST00000587914 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 GOLGA2Q08379 1002 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 DLC1Q96QB1 1528 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 ZMYND10O75800 440 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 MORC1Q86VD1 984 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 MED14O60244 1454 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 PTPRMP28827 1452 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 CFAP53Q96M91 514 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 ABCC11Q96J66 1382 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 E9PSI1 815 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 PSEN1P49768 467 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 SLFN5Q08AF3 891 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 PPP1R37O75864 691 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 SIRT1Q96EB6 747 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 ALKQ9UM73 1620 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC27Q2M243 656 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-208ENST00000587914 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 GABBR2O75899 941 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 MS4A1P11836 297 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 NLRP6P59044 892 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 RUNDC1Q96C34 613 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 APAF1O14727 1248 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 WDR63Q8IWG1 891 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 PRAM1Q96QH2 718 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 POGKQ9P215 609 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 ATP7BP35670 1465 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 AAMPQ13685 434 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 BARGINQ6ZT62 677 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CABP2Q9NPB3 220 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1W2PP64 1363 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 ZMYM3Q14202 1370 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 MTHFSP49914 203 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 TECPR2O15040 1411 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 SOX12O15370 315 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 WWC1Q8IX03 1113 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 STK26Q9P289 416 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 SHPRHQ149N8 1683 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 TNRQ92752 1358 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-208ENST00000587914 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms