RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 POGKQ9P215 609 aa28.81■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.8■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.79■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 APBA3O96018 575 aa28.78■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.78■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.78■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.76■■■□□ 2.2
SEMA4B-211ENST00000559322 ALS2Q96Q42 1657 aa28.74■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.73■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.73■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.73■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 NBPF14Q5TI25 921 aa28.73■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.72■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 STRN4Q9NRL3 753 aa28.71■■■□□ 2.19
SEMA4B-211ENST00000559322 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 DLC1Q96QB1 1528 aa28.69■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 PDE3BQ13370 1112 aa28.67■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 USP35Q9P2H5 1018 aa28.67■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 KIAA0232Q92628 1395 aa28.66■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 CHRNA2Q15822 529 aa28.66■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 SPON1Q9HCB6 807 aa28.65■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.65■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.64■■■□□ 2.18
SEMA4B-211ENST00000559322 RREB1Q92766 1687 aa28.64■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.64■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.63■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.61■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 EVA1CP58658 441 aa28.61■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 KCNQ2O43526 872 aa28.59■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 BARGINQ6ZT62 677 aa28.58■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.58■■■□□ 2.17
SEMA4B-211ENST00000559322 SSH2Q76I76 1423 aa28.54■■■□□ 2.16
SEMA4B-211ENST00000559322 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
SEMA4B-211ENST00000559322 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.53■■■□□ 2.16
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGRB1O14514 1584 aa28.53■■■□□ 2.16
SEMA4B-211ENST00000559322 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.52■■■□□ 2.16
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP7BP35670 1465 aa28.51■■■□□ 2.15
SEMA4B-211ENST00000559322 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SEMA4B-211ENST00000559322 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SEMA4B-211ENST00000559322 ITSN1Q15811 1721 aa28.46■■■□□ 2.15
SEMA4B-211ENST00000559322 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
SEMA4B-211ENST00000559322 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
SEMA4B-211ENST00000559322 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.44■■■□□ 2.14
SEMA4B-211ENST00000559322 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.42■■■□□ 2.14
SEMA4B-211ENST00000559322 ABTB2Q8N961 1025 aa28.4■■■□□ 2.14
SEMA4B-211ENST00000559322 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.4■■■□□ 2.14
SEMA4B-211ENST00000559322 CPDO75976 1380 aa28.38■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.38■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.38■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.38■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 ACEP12821 1306 aa28.38■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 PLSCR1O15162 318 aa28.37■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.36■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.36■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 CDK19Q9BWU1 502 aa28.35■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 ZBTB7AO95365 584 aa28.34■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.34■■■□□ 2.13
SEMA4B-211ENST00000559322 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.32■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.32■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 CRB1P82279 1406 aa28.32■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 CASZ1Q86V15 1759 aa28.32■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.31■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 GCP02774 474 aa28.31■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 NLRP13Q86W25 1043 aa28.31■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 USP19O94966 1318 aa28.31■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 DDB1Q16531 1140 aa28.3■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 PEAK1Q9H792 1746 aa28.29■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.28■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 MYOM1P52179 1685 aa28.27■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.27■■■□□ 2.12
SEMA4B-211ENST00000559322 PTGER2P43116 358 aa28.26■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 STAC3Q96MF2 364 aa28.26■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 STK32BQ9NY57 414 aa28.25■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 LRRC37A3O60309 1634 aa28.25■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.24■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.24■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 SBF2Q86WG5 1849 aa28.23■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 SYT17Q9BSW7 474 aa28.23■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 PROM2Q8N271 834 aa28.22■■■□□ 2.11
SEMA4B-211ENST00000559322 C1QTNF8P60827 252 aa28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms