RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3-216ENST00000545663 PPLO60437 1756 aa23.55■■□□□ 1.36
CLSTN3-216ENST00000545663 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3-216ENST00000545663 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.54■■□□□ 1.36
CLSTN3-216ENST00000545663 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 STRN4Q9NRL3 753 aa23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 USP35Q9P2H5 1018 aa23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 PDE3BQ13370 1112 aa23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 CHRNA2Q15822 529 aa23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 IFT172Q9UG01 1749 aa23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3-216ENST00000545663 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 ZBTB7AO95365 584 aa23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 RGL3Q3MIN7 710 aa23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 PTGER2P43116 358 aa23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 SIRT1Q96EB6 747 aa23.41■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 KIAA0232Q92628 1395 aa23.4■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 ALS2Q96Q42 1657 aa23.39■■□□□ 1.34
CLSTN3-216ENST00000545663 PRAM1Q96QH2 718 aa23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3-216ENST00000545663 SYT17Q9BSW7 474 aa23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3-216ENST00000545663 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CLSTN3-216ENST00000545663 MYOM1P52179 1685 aa23.38■■□□□ 1.33
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CLSTN3-216ENST00000545663 BARGINQ6ZT62 677 aa23.37■■□□□ 1.33
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CLSTN3-216ENST00000545663 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.35■■□□□ 1.33
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CLSTN3-216ENST00000545663 PIK3C2GO75747 1445 aa23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3-216ENST00000545663 EVA1CP58658 441 aa23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3-216ENST00000545663 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.32■■□□□ 1.32
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CLSTN3-216ENST00000545663 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 PROM2Q8N271 834 aa23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 SSH2Q76I76 1423 aa23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 CHD4Q14839 1912 aa23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 PLSCR1O15162 318 aa23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3-216ENST00000545663 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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CLSTN3-216ENST00000545663 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3-216ENST00000545663 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3-216ENST00000545663 GPR162Q16538 588 aa23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3-216ENST00000545663 PEAK1Q9H792 1746 aa23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3-216ENST00000545663 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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CLSTN3-216ENST00000545663 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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CLSTN3-216ENST00000545663 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC15A2Q16348 729 aa23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3-216ENST00000545663 ARXQ96QS3 562 aa23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3-216ENST00000545663 DLC1Q96QB1 1528 aa23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3-216ENST00000545663 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3-216ENST00000545663 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3-216ENST00000545663 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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CLSTN3-216ENST00000545663 TXNRD1Q16881 649 aa23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3-216ENST00000545663 SBF2Q86WG5 1849 aa23.14■■□□□ 1.29
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CLSTN3-216ENST00000545663 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3-216ENST00000545663 DDB1Q16531 1140 aa23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3-216ENST00000545663 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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CLSTN3-216ENST00000545663 ATP7BP35670 1465 aa23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3-216ENST00000545663 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3-216ENST00000545663 CPDO75976 1380 aa23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3-216ENST00000545663 MAP3K5Q99683 1374 aa23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3-216ENST00000545663 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CLSTN3-216ENST00000545663 LRRC37A3O60309 1634 aa23.05■■□□□ 1.28
CLSTN3-216ENST00000545663 KLHL34Q8N239 644 aa23.05■■□□□ 1.28
CLSTN3-216ENST00000545663 ABTB2Q8N961 1025 aa23.05■■□□□ 1.28
CLSTN3-216ENST00000545663 CRB1P82279 1406 aa23.05■■□□□ 1.28
CLSTN3-216ENST00000545663 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.04■■□□□ 1.28
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