RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533080.5

TSPAN18-211, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN18, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-211ENST00000533080 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.7■■■□□ 2.18
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TSPAN18-211ENST00000533080 ALS2Q96Q42 1657 aa28.67■■■□□ 2.18
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TSPAN18-211ENST00000533080 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.64■■■□□ 2.17
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TSPAN18-211ENST00000533080 ADGRB1O14514 1584 aa28.58■■■□□ 2.17
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TSPAN18-211ENST00000533080 STAC3Q96MF2 364 aa28.58■■■□□ 2.17
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TSPAN18-211ENST00000533080 PDE3BQ13370 1112 aa28.54■■■□□ 2.16
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TSPAN18-211ENST00000533080 NBPF14Q5TI25 921 aa28.54■■■□□ 2.16
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TSPAN18-211ENST00000533080 YY1P25490 414 aa28.45■■■□□ 2.14
TSPAN18-211ENST00000533080 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.45■■■□□ 2.14
TSPAN18-211ENST00000533080 SSH2Q76I76 1423 aa28.44■■■□□ 2.14
TSPAN18-211ENST00000533080 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.44■■■□□ 2.14
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TSPAN18-211ENST00000533080 SPON1Q9HCB6 807 aa28.41■■■□□ 2.14
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TSPAN18-211ENST00000533080 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPAN18-211ENST00000533080 USP19O94966 1318 aa28.32■■■□□ 2.12
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TSPAN18-211ENST00000533080 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPAN18-211ENST00000533080 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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TSPAN18-211ENST00000533080 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPAN18-211ENST00000533080 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPAN18-211ENST00000533080 PLSCR1O15162 318 aa28.26■■■□□ 2.11
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TSPAN18-211ENST00000533080 DDB1Q16531 1140 aa28.21■■■□□ 2.11
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TSPAN18-211ENST00000533080 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.21■■■□□ 2.11
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TSPAN18-211ENST00000533080 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.18■■■□□ 2.1
TSPAN18-211ENST00000533080 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPAN18-211ENST00000533080 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPAN18-211ENST00000533080 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPAN18-211ENST00000533080 NLRP6P59044 892 aa28.14■■■□□ 2.1
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TSPAN18-211ENST00000533080 LRRC37A3O60309 1634 aa28.1■■■□□ 2.09
TSPAN18-211ENST00000533080 CABP2Q9NPB3 220 aa28.09■■■□□ 2.09
TSPAN18-211ENST00000533080 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.09■■■□□ 2.09
TSPAN18-211ENST00000533080 USP6P35125 1406 aa28.09■■■□□ 2.09
TSPAN18-211ENST00000533080 STK32BQ9NY57 414 aa28.08■■■□□ 2.09
TSPAN18-211ENST00000533080 SLIT3O75094 1523 aa28.08■■■□□ 2.08
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