RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.06■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.06■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 PPP2R1AP30153 589 aa21.06■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 CCER2I3L3R5 266 aa21.04■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.04■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 SOX12O15370 315 aa21.04■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.03■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.03■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.02■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.01■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.01■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 SSH2Q76I76 1423 aa21.01■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 PSME1Q06323 249 aa21■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 DCCP43146 1447 aa21■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 PIK3C2AO00443 1686 aa21■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 SLAIN2Q9P270 581 aa20.99■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 NLRP13Q86W25 1043 aa20.99■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 BRINP3Q76B58 766 aa20.97■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.97■□□□□ 0.95
TRPS1-206ENST00000517323 ABTB2Q8N961 1025 aa20.95■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 MTHFSP49914 203 aa20.95■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 NSD2O96028 1365 aa20.94■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.94■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 COG3Q96JB2 828 aa20.94■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 NLRP6P59044 892 aa20.93■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 KIF1AQ12756 1690 aa20.93■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.92■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.91■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.91■□□□□ 0.94
TRPS1-206ENST00000517323 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.88■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 POLKQ9UBT6 870 aa20.88■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 PIP4K2BP78356 416 aa20.87■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.87■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.86■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 PXDNQ92626 1479 aa20.86■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.84■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.84■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 SHPRHQ149N8 1683 aa20.84■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 PEAK1Q9H792 1746 aa20.84■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 ALS2Q96Q42 1657 aa20.83■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.83■□□□□ 0.93
TRPS1-206ENST00000517323 USP31Q70CQ4 1352 aa20.81■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.79■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.79■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 LTN1O94822 1766 aa20.78■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.78■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.78■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 USP54Q70EL1 1684 aa20.77■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.77■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
TRPS1-206ENST00000517323 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.76■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 NFAT5O94916 1531 aa20.76■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 GCP02774 474 aa20.75■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 CFAP53Q96M91 514 aa20.75■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 CERKQ8TCT0 537 aa20.74■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 SBNO1A3KN83 1393 aa20.74■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.73■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 AMPHP49418 695 aa20.72■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 TOM1O60784 492 aa20.72■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 USP19O94966 1318 aa20.71■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 SLIT3O75094 1523 aa20.71■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.71■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 HMOX1P09601 288 aa20.7■□□□□ 0.91
TRPS1-206ENST00000517323 RGPD5Q99666 1765 aa20.7■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 PHLPP1O60346 1717 aa20.69■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 CHRNA2Q15822 529 aa20.69■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 HOXC9P31274 260 aa20.69■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 IL13P35225 146 aa20.69■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.68■□□□□ 0.9
TRPS1-206ENST00000517323 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
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