RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 TECPR2O15040 1411 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-207ENST00000510021 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.76■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 IFT172Q9UG01 1749 aa23.74■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 PDE3BQ13370 1112 aa23.74■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.73■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 ALS2Q96Q42 1657 aa23.73■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 PPLO60437 1756 aa23.71■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.71■■□□□ 1.39
UBE2B-207ENST00000510021 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.69■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 STK26Q9P289 416 aa23.69■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 MAP3K5Q99683 1374 aa23.68■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.68■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 ROCK1Q13464 1354 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 PLSCR1O15162 318 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 BARGINQ6ZT62 677 aa23.67■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC11Q96J66 1382 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 HSPA6P17066 643 aa23.66■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
UBE2B-207ENST00000510021 GPR162Q16538 588 aa23.64■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 MTFR1LQ9H019 292 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 STRN4Q9NRL3 753 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 USP35Q9P2H5 1018 aa23.63■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 PEAK1Q9H792 1746 aa23.62■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 SBF2Q86WG5 1849 aa23.61■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 ARXQ96QS3 562 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 KIAA0232Q92628 1395 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 PROM2Q8N271 834 aa23.58■■□□□ 1.37
UBE2B-207ENST00000510021 SSH2Q76I76 1423 aa23.58■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 CHRNA2Q15822 529 aa23.57■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.56■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.56■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.56■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 APLP2Q06481 763 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 STK32BQ9NY57 414 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 SLC15A2Q16348 729 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 ATP10DQ9P241 1426 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 CAPN15O75808 1086 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2B-207ENST00000510021 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 SLC34A2O95436 690 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 SIRT1Q96EB6 747 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 EVA1CP58658 441 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 ATP7BP35670 1465 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UBE2B-207ENST00000510021 TXNRD1Q16881 649 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 LRRC37A3O60309 1634 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 PRELPP51888 382 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2B-207ENST00000510021 PIK3C2GO75747 1445 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 KLHL34Q8N239 644 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 GRIN3BO60391 1043 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.333e-17■■■□□ 15.4
UBE2B-207ENST00000510021 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 PAPPAQ13219 1627 aa23.37■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 BCL9O00512 1426 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 ADCY9O60503 1353 aa23.36■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 PRAM1Q96QH2 718 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.35■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 APLP1P51693 650 aa23.34■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.34■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.33■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 TNS4Q8IZW8 715 aa23.33■■□□□ 1.33
UBE2B-207ENST00000510021 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 DDB1Q16531 1140 aa23.32■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.32■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 CPDO75976 1380 aa23.31■■□□□ 1.32
UBE2B-207ENST00000510021 AKAP12Q02952 1782 aa23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms