RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 SPON1Q9HCB6 807 aa23.57■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 PIK3C2GO75747 1445 aa23.57■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.55■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.54■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.53■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.53■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 RREB1Q92766 1687 aa23.53■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.53■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 PRAM1Q96QH2 718 aa23.52■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SRPRB-204ENST00000484684 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.51■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.51■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 KCNQ2O43526 872 aa23.51■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 STRN4Q9NRL3 753 aa23.51■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 ALS2Q96Q42 1657 aa23.51■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 PDE3BQ13370 1112 aa23.49■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 POGKQ9P215 609 aa23.49■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 USP35Q9P2H5 1018 aa23.48■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SRPRB-204ENST00000484684 CHRNA2Q15822 529 aa23.45■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 KIAA0232Q92628 1395 aa23.44■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.44■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.44■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.43■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.43■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 EVA1CP58658 441 aa23.41■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 BARGINQ6ZT62 677 aa23.4■■□□□ 1.34
SRPRB-204ENST00000484684 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.38■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 DLC1Q96QB1 1528 aa23.38■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 SSH2Q76I76 1423 aa23.36■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.36■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.34■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.34■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 IFFO2Q5TF58 517 aa23.33■■□□□ 1.33
SRPRB-204ENST00000484684 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.32■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.32■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 C1QTNF8P60827 252 aa23.3■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.3■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB7AO95365 584 aa23.29■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 ATP7BP35670 1465 aa23.29■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 CASZ1Q86V15 1759 aa23.27■■□□□ 1.32
SRPRB-204ENST00000484684 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.26■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.26■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.26■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 PLSCR1O15162 318 aa23.26■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 MYOM1P52179 1685 aa23.25■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 UTRNP46939 3433 aa23.25■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.24■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 ADGRB1O14514 1584 aa23.23■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 ITSN1Q15811 1721 aa23.23■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 PTGER2P43116 358 aa23.23■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 SYT17Q9BSW7 474 aa23.21■■□□□ 1.31
SRPRB-204ENST00000484684 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.19■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 CPDO75976 1380 aa23.19■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 ABTB2Q8N961 1025 aa23.18■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 STK32BQ9NY57 414 aa23.18■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 PEAK1Q9H792 1746 aa23.18■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 CHD4Q14839 1912 aa23.18■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 DDB1Q16531 1140 aa23.17■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 CRB1P82279 1406 aa23.16■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 ACEP12821 1306 aa23.15■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 SBF2Q86WG5 1849 aa23.15■■□□□ 1.3
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.14■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.14■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 PROM2Q8N271 834 aa23.14■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 MTFR1LQ9H019 292 aa23.14■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 USP19O94966 1318 aa23.13■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 LRRC37A3O60309 1634 aa23.13■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 GCP02774 474 aa23.12■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 SLC15A2Q16348 729 aa23.11■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 NLRP13Q86W25 1043 aa23.11■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 TXNRD1Q16881 649 aa23.1■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 CDK19Q9BWU1 502 aa23.1■■□□□ 1.29
SRPRB-204ENST00000484684 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms