RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468454.1

PTPRN-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-212ENST00000468454 KCNQ2O43526 872 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 IFFO2Q5TF58 517 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 NBPF14Q5TI25 921 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 CHRNA2Q15822 529 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 STRN4Q9NRL3 753 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 USP35Q9P2H5 1018 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 ALS2Q96Q42 1657 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRN-212ENST00000468454 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 PIK3C2GO75747 1445 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 PRAM1Q96QH2 718 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 SIRT1Q96EB6 747 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 KIAA0232Q92628 1395 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 PDE3BQ13370 1112 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-212ENST00000468454 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 C1QTNF8P60827 252 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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PTPRN-212ENST00000468454 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 CEP350Q5VT06 3117 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 ZBTB7AO95365 584 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 MYOM1P52179 1685 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 POGKQ9P215 609 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 CASZ1Q86V15 1759 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-212ENST00000468454 PTGER2P43116 358 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 BARGINQ6ZT62 677 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 EVA1CP58658 441 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRN-212ENST00000468454 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 SSH2Q76I76 1423 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRN-212ENST00000468454 PROM2Q8N271 834 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 SYT17Q9BSW7 474 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRN-212ENST00000468454 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 DLC1Q96QB1 1528 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 PEAK1Q9H792 1746 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 PLSCR1O15162 318 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 CHD4Q14839 1912 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRN-212ENST00000468454 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 SBF2Q86WG5 1849 aa21.57■■□□□ 1.04
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PTPRN-212ENST00000468454 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 ADGRB1O14514 1584 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-212ENST00000468454 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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PTPRN-212ENST00000468454 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 ATP7BP35670 1465 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 LRRC37A3O60309 1634 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 STK32BQ9NY57 414 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 TXNRD1Q16881 649 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 ABTB2Q8N961 1025 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 MTFR1LQ9H019 292 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 CPDO75976 1380 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 DDB1Q16531 1140 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 ACEP12821 1306 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 GPR162Q16538 588 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 ARXQ96QS3 562 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 CRB1P82279 1406 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-212ENST00000468454 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-212ENST00000468454 GCP02774 474 aa21.44■■□□□ 1.02
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