RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 DRC7Q8IY82 874 aa14.99□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.99□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 PBRM1Q86U86 1689 aa14.99□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 PKP1Q13835 747 aa14.99□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.99□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.99□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.98□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.98□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 ERICH4A6NGS2 130 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 IFT140Q96RY7 1462 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 ZBTB22O15209 634 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 NUCB1Q02818 461 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 SPC24Q8NBT2 197 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 CFAP44Q96MT7 982 aa14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 GPT2Q8TD30 523 aa14.96□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 ARHGEF11O15085 1522 aa14.96□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.96□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SZRD1-201ENST00000401088 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.96□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 ADCY5O95622 1261 aa14.95□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF592Q92610 1267 aa14.95□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.95□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 FBLN2P98095 1184 aa14.94□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.94□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 MTHFSP49914 203 aa14.93□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.93□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 PIK3C2GO75747 1445 aa14.93□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.93□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 IFT57Q9NWB7 429 aa14.92□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 NEK4P51957 841 aa14.92□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.92□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 GCC1Q96CN9 775 aa14.92□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.91□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.91□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.91□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.91□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM51Q9NW97 253 aa14.91□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 CUL7Q14999 1698 aa14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 KIF2CQ99661 725 aa14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 FEZ1Q99689 392 aa14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 TIGD1Q96MW7 591 aa14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 OGFRQ9NZT2 677 aa14.9□□□□□ -0.02
SZRD1-201ENST00000401088 REC8O95072 547 aa14.89□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.89□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.88□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.88□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.88□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.87□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 MCCP23508 829 aa14.87□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.87□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 ADAMTS12P58397 1594 aa14.87□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 NPHP1O15259 732 aa14.86□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 TPM3P06753 285 aa14.85□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 UVSSAQ2YD98 709 aa14.85□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.85□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.85□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 SAMD9Q5K651 1589 aa14.84□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SZRD1-201ENST00000401088 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 FIBPO43427 364 aa14.83□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.83□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.82□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.82□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.041e-12■■■■□ 19.5
SZRD1-201ENST00000401088 KRT222Q8N1A0 295 aa14.82□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.81□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.81□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 TNNT1P13805 278 aa14.81□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 CCDC27Q2M243 656 aa14.81□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.81□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.8□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 TMX3Q96JJ7 454 aa14.8□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 USP26Q9BXU7 913 aa14.8□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 USP48Q86UV5 1035 aa14.8□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 CERS3Q8IU89 383 aa14.8□□□□□ -0.04
SZRD1-201ENST00000401088 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.7 ms