RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRL1O94910 1474 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ESPNB1AK53 854 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 TMX1Q9H3N1 280 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 NAT1P18440 290 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PAX7P23759 505 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 IRF5Q13568 498 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC181Q5TID7 509 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 FOSBP53539 338 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 POGKQ9P215 609 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K1Q13233 1512 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PLCH2O75038 1416 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF853P0CG23 659 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 TULP2O00295 520 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ECEL1O95672 775 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF16BQ96L93 1317 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PLXNC1O60486 1568 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM163BP0C2L3 166 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCC1P33527 1531 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 COQ9O75208 318 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 SKILP12757 684 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MAF1Q9H063 256 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 EFCC1Q9HA90 598 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP2B3Q16720 1220 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 TOMM22Q9NS69 142 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 DONSONQ9NYP3 566 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 INHBEP58166 350 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 CAND2O75155 1236 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM161AQ3B820 660 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ERICH4A6NGS2 130 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 PICK1Q9NRD5 415 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 NAT2P11245 290 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC4A3P48751 1232 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 AKNAQ7Z591 1439 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 SUFUQ9UMX1 484 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MADDQ8WXG6 1647 aa8.41□□□□□ -1.06
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