RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000156342.1

Hoxd3os1-204, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 796 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rgs17Q9QZB0 210 aa29,56■■■□□ 2,32
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Astn2Q80Z10 1352 aa29,06■■■□□ 2,24
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ankrd23Q812A3 306 aa28,91■■■□□ 2,22
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ginm1Q91WR6 327 aa28,91■■■□□ 2,22
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Akap11E9Q777 1895 aa28,91■■■□□ 2,22
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP28,9■■■□□ 2,22
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 CemipQ8BI06 1361 aa28,89■■■□□ 2,22
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Nwd2Q6P5U7 1742 aa28,89■■■□□ 2,22
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP28,89■■■□□ 2,22
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zpr1Q62384 459 aa28,86■■■□□ 2,21
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Mdc1Q5PSV9 1707 aa28,85■■■□□ 2,21
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 OptnQ8K3K8 584 aa28,82■■■□□ 2,2
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ubr1O70481 1757 aa28,82■■■□□ 2,2
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