RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000156342.1

Hoxd3os1-204, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 796 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48.08■■■■■ 5.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NischQ80TM9 1593 aa47.32■■■■■ 5.17
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Abcc8B2RUS7 1588 aa45.83■■■■■ 4.93
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Abcc9P70170 1546 aa45.7■■■■■ 4.91
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 ScribQ80U72 1612 aa44.37■■■■■ 4.69
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NacadQ5SWP3 1504 aa43.08■■■■■ 4.49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Kdm5dQ62240 1548 aa42.88■■■■■ 4.46
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42.2■■■■■ 4.35
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42.1■■■■■ 4.33
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 BicraF8VPZ9 1578 aa41.6■■■■■ 4.25
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa41.22■■■■■ 4.19
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa41.05■■■■■ 4.16
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Baz1aO88379 1555 aa40.61■■■■■ 4.09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rhox8Q6VSS7 320 aa40.6■■■■■ 4.09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc180J3QNE4 1664 aa40.59■■■■■ 4.09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40.57■■■■■ 4.09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ercc6F8VPZ5 1481 aa39.88■■■■□ 3.98
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa39.79■■■■□ 3.96
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Smarca2Q6DIC0 1577 aa39.67■■■■□ 3.94
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa39.51■■■■□ 3.92
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fam135aQ6NS59 1506 aa39.45■■■■□ 3.91
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa39.33■■■■□ 3.89
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39.23■■■■□ 3.87
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Baz1bQ9Z277 1479 aa39.17■■■■□ 3.86
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39.16■■■■□ 3.86
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ubl4bQ9CQ84 188 aa38.85■■■■□ 3.81
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Mrc2Q64449 1479 aa38.59■■■■□ 3.77
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Unc13aQ4KUS2 1712 aa38.55■■■■□ 3.76
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rtl1Q7M732 1744 aa38.46■■■■□ 3.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38.45■■■■□ 3.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 CftrP26361 1476 aa38.43■■■■□ 3.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Synj1Q8CHC4 1574 aa38.27■■■■□ 3.72
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa38.01■■■■□ 3.68
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Trim41Q5NCC3 630 aa37.78■■■■□ 3.64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cux2P70298 1426 aa37.77■■■■□ 3.64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dnajc5P60904 198 aa37.76■■■■□ 3.64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa37.72■■■■□ 3.63
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Kif15Q6P9L6 1387 aa37.71■■■■□ 3.63
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Kif21aQ9QXL2 1672 aa37.51■■■■□ 3.6
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Lamc3Q9R0B6 1581 aa37.43■■■■□ 3.58
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cep164Q5DU05 1446 aa37.27■■■■□ 3.56
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Shroom2A2ALU4 1481 aa37.03■■■■□ 3.52
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc18Q640L5 1455 aa37.03■■■■□ 3.52
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Il27Q8K3I6 234 aa36.91■■■■□ 3.5
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Plb1Q3TTY0 1478 aa36.86■■■■□ 3.49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 TnnQ80Z71 1560 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Crocc2F6XLV1 1638 aa36.77■■■■□ 3.48
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Golga3P55937 1487 aa36.75■■■■□ 3.47
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Top2bQ64511 1612 aa36.71■■■■□ 3.47
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Camsap1A2AHC3 1581 aa36.71■■■■□ 3.47
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cngb1E1AZ71 1325 aa36.69■■■■□ 3.46
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ift140E9PY46 1464 aa36.6■■■■□ 3.45
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Col17a1Q07563 1470 aa36.53■■■■□ 3.44
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rusc2Q80U22 1514 aa36.49■■■■□ 3.43
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fmn1Q05860 1466 aa36.46■■■■□ 3.43
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Duox2A2AQ99 1517 aa36.36■■■■□ 3.41
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Grin2bQ01097 1482 aa36.18■■■■□ 3.38
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Disp1Q3TDN0 1521 aa36.17■■■■□ 3.38
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36.11■■■■□ 3.37
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Efcab5A0JP43 1406 aa36.03■■■■□ 3.36
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Samd9lQ69Z37 1561 aa36■■■■□ 3.35
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Setd1bQ8CFT2 1985 aa35.93■■■■□ 3.34
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fgd6Q69ZL1 1399 aa35.78■■■■□ 3.32
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Grin2aP35436 1464 aa35.78■■■■□ 3.32
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rad54l2Q99NG0 1466 aa35.78■■■■□ 3.32
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NrkQ9R0G8 1455 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Adgrl3Q80TS3 1537 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 PtprkP35822 1457 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Magi3Q9EQJ9 1476 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa35.63■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa35.6■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cep170Q6A065 1588 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35.55■■■■□ 3.28
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AknaQ80VW7 1404 aa35.53■■■■□ 3.28
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm156Q58A37 223 aa35.52■■■■□ 3.28
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Shroom4Q1W617 1475 aa35.49■■■■□ 3.27
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 SynmQ70IV5 1561 aa35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.6 ms