RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000156342.1

Hoxd3os1-204, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 796 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48.08■■■■■ 5.29
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NacadQ5SWP3 1504 aa43.08■■■■■ 4.49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Kdm5dQ62240 1548 aa42.88■■■■■ 4.46
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42.2■■■■■ 4.35
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42.1■■■■■ 4.33
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 BicraF8VPZ9 1578 aa41.6■■■■■ 4.25
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc180J3QNE4 1664 aa40.59■■■■■ 4.09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40.57■■■■■ 4.09
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fam135aQ6NS59 1506 aa39.45■■■■□ 3.91
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa39.33■■■■□ 3.89
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39.23■■■■□ 3.87
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Baz1bQ9Z277 1479 aa39.17■■■■□ 3.86
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39.16■■■■□ 3.86
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38.45■■■■□ 3.75
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Synj1Q8CHC4 1574 aa38.27■■■■□ 3.72
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa38.01■■■■□ 3.68
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cux2P70298 1426 aa37.77■■■■□ 3.64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dnajc5P60904 198 aa37.76■■■■□ 3.64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa37.72■■■■□ 3.63
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Camsap1A2AHC3 1581 aa36.71■■■■□ 3.47
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cngb1E1AZ71 1325 aa36.69■■■■□ 3.46
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Disp1Q3TDN0 1521 aa36.17■■■■□ 3.38
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Efcab5A0JP43 1406 aa36.03■■■■□ 3.36
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Adgrl3Q80TS3 1537 aa35.71■■■■□ 3.31
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Magi3Q9EQJ9 1476 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa35.63■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa35.6■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cep170Q6A065 1588 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35.55■■■■□ 3.28
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Shroom4Q1W617 1475 aa35.49■■■■□ 3.27
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 SynmQ70IV5 1561 aa35.46■■■■□ 3.27
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