RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000156342.1

Hoxd3os1-204, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 796 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48,08■■■■■ 5,29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NischQ80TM9 1593 aa47,32■■■■■ 5,17
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Abcc8B2RUS7 1588 aa45,83■■■■■ 4,93
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Abcc9P70170 1546 aa45,7■■■■■ 4,91
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 ScribQ80U72 1612 aa44,37■■■■■ 4,69
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NacadQ5SWP3 1504 aa43,08■■■■■ 4,49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Kdm5dQ62240 1548 aa42,88■■■■■ 4,46
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42,2■■■■■ 4,35
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42,1■■■■■ 4,33
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 BicraF8VPZ9 1578 aa41,6■■■■■ 4,25
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa41,22■■■■■ 4,19
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa41,05■■■■■ 4,16
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP40,74■■■■■ 4,11
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Baz1aO88379 1555 aa40,61■■■■■ 4,09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rhox8Q6VSS7 320 aa40,6■■■■■ 4,09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc180J3QNE4 1664 aa40,59■■■■■ 4,09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40,57■■■■■ 4,09
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40,41■■■■■ 4,06
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40,2■■■■■ 4,03
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40,13■■■■■ 4,02
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ercc6F8VPZ5 1481 aa39,88■■■■□ 3,98
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa39,79■■■■□ 3,96
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP39,69■■■■□ 3,94
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Smarca2Q6DIC0 1577 aa39,67■■■■□ 3,94
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa39,51■■■■□ 3,92
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fam135aQ6NS59 1506 aa39,45■■■■□ 3,91
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa39,33■■■■□ 3,89
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39,23■■■■□ 3,87
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Baz1bQ9Z277 1479 aa39,17■■■■□ 3,86
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39,16■■■■□ 3,86
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39,16■■■■□ 3,86
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ubl4bQ9CQ84 188 aa38,85■■■■□ 3,81
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Mrc2Q64449 1479 aa38,59■■■■□ 3,77
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Unc13aQ4KUS2 1712 aa38,55■■■■□ 3,76
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rtl1Q7M732 1744 aa38,46■■■■□ 3,75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38,45■■■■□ 3,75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 CftrP26361 1476 aa38,43■■■■□ 3,74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP38,35■■■■□ 3,73
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Synj1Q8CHC4 1574 aa38,27■■■■□ 3,72
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa38,01■■■■□ 3,68
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP37,94■■■■□ 3,66
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP37,79■■■■□ 3,64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Trim41Q5NCC3 630 aa37,78■■■■□ 3,64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cux2P70298 1426 aa37,77■■■■□ 3,64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dnajc5P60904 198 aa37,76■■■■□ 3,64
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa37,72■■■■□ 3,63
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Kif15Q6P9L6 1387 aa37,71■■■■□ 3,63
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Kif21aQ9QXL2 1672 aa37,51■■■■□ 3,6
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37,47■■■■□ 3,59
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Lamc3Q9R0B6 1581 aa37,43■■■■□ 3,58
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cep164Q5DU05 1446 aa37,27■■■■□ 3,56
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37,22■■■■□ 3,55
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Shroom2A2ALU4 1481 aa37,03■■■■□ 3,52
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc18Q640L5 1455 aa37,03■■■■□ 3,52
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP36,94■■■■□ 3,5
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP36,93■■■■□ 3,5
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Il27Q8K3I6 234 aa36,91■■■■□ 3,5
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Plb1Q3TTY0 1478 aa36,86■■■■□ 3,49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 TnnQ80Z71 1560 aa36,83■■■■□ 3,49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP36,83■■■■□ 3,49
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Crocc2F6XLV1 1638 aa36,77■■■■□ 3,48
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Golga3P55937 1487 aa36,75■■■■□ 3,47
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Top2bQ64511 1612 aa36,71■■■■□ 3,47
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Camsap1A2AHC3 1581 aa36,71■■■■□ 3,47
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cngb1E1AZ71 1325 aa36,69■■■■□ 3,46
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36,66■■■■□ 3,46
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ift140E9PY46 1464 aa36,6■■■■□ 3,45
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP36,53■■■■□ 3,44
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Col17a1Q07563 1470 aa36,53■■■■□ 3,44
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rusc2Q80U22 1514 aa36,49■■■■□ 3,43
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fmn1Q05860 1466 aa36,46■■■■□ 3,43
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36,4■■■■□ 3,42
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Duox2A2AQ99 1517 aa36,36■■■■□ 3,41
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Grin2bQ01097 1482 aa36,18■■■■□ 3,38
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP36,18■■■■□ 3,38
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Disp1Q3TDN0 1521 aa36,17■■■■□ 3,38
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36,12■■■■□ 3,37
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36,11■■■■□ 3,37
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36,04■■■■□ 3,36
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Efcab5A0JP43 1406 aa36,03■■■■□ 3,36
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Samd9lQ69Z37 1561 aa36■■■■□ 3,35
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Setd1bQ8CFT2 1985 aa35,93■■■■□ 3,34
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP35,79■■■■□ 3,32
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fgd6Q69ZL1 1399 aa35,78■■■■□ 3,32
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Grin2aP35436 1464 aa35,78■■■■□ 3,32
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rad54l2Q99NG0 1466 aa35,78■■■■□ 3,32
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NrkQ9R0G8 1455 aa35,71■■■■□ 3,31
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Adgrl3Q80TS3 1537 aa35,71■■■■□ 3,31
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 PtprkP35822 1457 aa35,7■■■■□ 3,31
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Magi3Q9EQJ9 1476 aa35,68■■■■□ 3,3
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa35,63■■■■□ 3,29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP35,61■■■■□ 3,29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa35,6■■■■□ 3,29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa35,59■■■■□ 3,29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cep170Q6A065 1588 aa35,59■■■■□ 3,29
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35,55■■■■□ 3,28
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AknaQ80VW7 1404 aa35,53■■■■□ 3,28
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm156Q58A37 223 aa35,52■■■■□ 3,28
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Shroom4Q1W617 1475 aa35,49■■■■□ 3,27
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 SynmQ70IV5 1561 aa35,46■■■■□ 3,27
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