RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP30,43■■■□□ 2,46
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fyb1O35601 819 aa30,42■■■□□ 2,46
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dixdc1Q80Y83 711 aa30,42■■■□□ 2,46
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 InhbeO08717 350 aa30,39■■■□□ 2,46
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rgs17Q9QZB0 210 aa30,37■■■□□ 2,45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psrc1Q9D0P7 329 aa30,36■■■□□ 2,45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP30,36■■■□□ 2,45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa30,32■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 InsrP15208 1372 aa30,31■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col16a1Q8BLX7 1580 aa30,3■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col22a1E9Q7P1 1613 aa30,29■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nfat5Q9WV30 1534 aa30,29■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gsto1O09131 240 aa30,29■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PaskQ8CEE6 1383 aa30,28■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa30,28■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Txnrd1Q9JMH6 613 aa30,28■■■□□ 2,44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP30,26■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tet3Q8BG87 1668 aa30,26■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sbno1Q689Z5 1390 aa30,26■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TimelessQ9R1X4 1197 aa30,24■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Shank2Q80Z38 1476 aa30,23■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ildr2B5TVM2 661 aa30,22■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dzip1Q8BMD2 852 aa30,22■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP30,22■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcl9lQ67FY2 1494 aa30,21■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP30,21■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ZgpatQ8VDM1 511 aa30,21■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ltbp1Q8CG19 1712 aa30,21■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FanciQ8K368 1330 aa30,21■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zmym3Q9JLM4 1370 aa30,2■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rtl5Q5DTT4 599 aa30,2■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Idi2Q8BFZ6 227 aa30,2■■■□□ 2,43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr66E9Q743 1299 aa30,18■■■□□ 2,42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa30,17■■■□□ 2,42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k19E9Q3S4 1311 aa30,17■■■□□ 2,42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc24a1Q91WD8 1130 aa30,16■■■□□ 2,42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nid2O88322 1403 aa30,15■■■□□ 2,42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CatipB9EKE5 520 aa30,15■■■□□ 2,42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HdgfP51859 237 aaKnown RBP30,15■■■□□ 2,42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plekhg5Q66T02 1073 aa30,14■■■□□ 2,42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cacna1sQ02789 1880 aa30,13■■■□□ 2,41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnks1bp1P58871 1720 aa30,12■■■□□ 2,41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cnga1P29974 684 aa30,1■■■□□ 2,41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ClspnQ80YR7 1315 aa30,08■■■□□ 2,41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sugp2Q8CH09 1067 aa30,08■■■□□ 2,41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc4a1apE9PX68 744 aa30,07■■■□□ 2,4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21698A0A087WQP8 267 aa30,06■■■□□ 2,4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21671G3UY31 267 aa30,06■■■□□ 2,4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc129Q14B48 1034 aa30,05■■■□□ 2,4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa30,04■■■□□ 2,4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gimap6Q8K349 305 aa30,04■■■□□ 2,4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Robo1O89026 1612 aa30,03■■■□□ 2,4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam184bQ0KK56 942 aa30,02■■■□□ 2,4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmf1B9EKI3 1091 aa30,01■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc6D3YZP9 469 aa30,01■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PrxO55103 1391 aa30,01■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fer1l6E0CZ42 1862 aa29,99■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29,99■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubap1lG3UW59 384 aa29,99■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf335A2A5K6 1337 aa29,98■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pard3Q99NH2 1333 aa29,98■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pank3Q8R2W9 370 aa29,98■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mast2Q60592 1734 aa29,96■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif16bB1AVY7 1312 aa29,96■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ncoa4Q5U4H9 625 aa29,95■■■□□ 2,39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ly75Q60767 1723 aa29,95■■■□□ 2,38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa29,93■■■□□ 2,38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa29,93■■■□□ 2,38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa29,92■■■□□ 2,38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Inpp5dQ9ES52 1191 aa29,9■■■□□ 2,38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kat6bQ8BRB7 1872 aa29,9■■■□□ 2,38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP29,88■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dennd6aQ8BH65 605 aa29,87■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slx1bQ8BX32 270 aa29,86■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pm20d1Q8C165 503 aa29,85■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zeb2Q9R0G7 1215 aa29,85■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa29,85■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Card10P58660 1021 aa29,84■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zscan10Q3URR7 782 aa29,83■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Taok3Q8BYC6 898 aa29,83■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP29,83■■■□□ 2,37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TnrQ8BYI9 1358 aa29,82■■■□□ 2,36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nlgn1Q99K10 843 aa29,82■■■□□ 2,36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29,82■■■□□ 2,36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnajc10Q9DC23 793 aa29,81■■■□□ 2,36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Amotl2Q8K371 772 aa29,8■■■□□ 2,36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnh5Q920E3 988 aa29,8■■■□□ 2,36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akap11E9Q777 1895 aa29,79■■■□□ 2,36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa29,76■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cabp4Q8VHC5 271 aa29,76■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dcaf11Q91VU6 549 aa29,76■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubr1O70481 1757 aa29,76■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Astn2Q80Z10 1352 aa29,76■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29,75■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fmnl2A2APV2 1086 aa29,73■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TatQ8QZR1 454 aa29,73■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa29,72■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nwd2Q6P5U7 1742 aa29,72■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP29,72■■■□□ 2,35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scn7aB1AYL1 1681 aa29,72■■■□□ 2,35
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