RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc4a1apE9PX68 744 aa30.07■■■□□ 2.4
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21671G3UY31 267 aa30.06■■■□□ 2.4
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa29.93■■■□□ 2.38
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Taok3Q8BYC6 898 aa29.83■■■□□ 2.37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fmnl2A2APV2 1086 aa29.73■■■□□ 2.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TatQ8QZR1 454 aa29.73■■■□□ 2.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa29.72■■■□□ 2.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nwd2Q6P5U7 1742 aa29.72■■■□□ 2.35
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scn7aB1AYL1 1681 aa29.72■■■□□ 2.35
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