RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020552.6

Tpgs1-201, Transcript of Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tpgs1, Length 1,143 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 ZgpatQ8VDM1 511 aa25.32■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 TimelessQ9R1X4 1197 aa25.32■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Idi2Q8BFZ6 227 aa25.31■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Rundc1Q0VDN7 615 aa25.3■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Txnrd1Q9JMH6 613 aa25.3■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 HdgfP51859 237 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 PaskQ8CEE6 1383 aa25.29■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Col16a1Q8BLX7 1580 aa25.27■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Dzip1Q8BMD2 852 aa25.27■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 FanciQ8K368 1330 aa25.27■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sbno1Q689Z5 1390 aa25.27■■□□□ 1.64
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Rtl5Q5DTT4 599 aa25.26■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa25.26■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 CatipB9EKE5 520 aa25.25■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ccdc6D3YZP9 469 aa25.25■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Card11Q8CIS0 1159 aa25.25■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Nfat5Q9WV30 1534 aa25.24■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Rock2P70336 1388 aa25.24■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Zmym3Q9JLM4 1370 aa25.24■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Map3k19E9Q3S4 1311 aa25.24■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Pola1P33609 1465 aa25.22■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa25.22■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Gimap6Q8K349 305 aa25.19■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Bcl9lQ67FY2 1494 aa25.19■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Shank2Q80Z38 1476 aa25.18■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Robo1O89026 1612 aa25.18■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Nid2O88322 1403 aa25.17■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 InsrP15208 1372 aa25.17■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tet3Q8BG87 1668 aa25.16■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tnks1bp1P58871 1720 aa25.15■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Cnga1P29974 684 aa25.15■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Gm21698A0A087WQP8 267 aa25.14■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Gm21671G3UY31 267 aa25.14■■□□□ 1.62
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Znf335A2A5K6 1337 aa25.13■■□□□ 1.61
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa25.11■■□□□ 1.61
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sugp2Q8CH09 1067 aa25.11■■□□□ 1.61
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ltbp1Q8CG19 1712 aa25.1■■□□□ 1.61
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ccdc129Q14B48 1034 aa25.1■■□□□ 1.61
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ncoa4Q5U4H9 625 aa25.09■■□□□ 1.61
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Kif16bB1AVY7 1312 aa25.07■■□□□ 1.6
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 TonslQ6NZL6 1363 aa25.06■■□□□ 1.6
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Pard3Q99NH2 1333 aa25.06■■□□□ 1.6
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa25.05■■□□□ 1.6
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.04■■□□□ 1.6
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Cacna1sQ02789 1880 aa25.04■■□□□ 1.6
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 OscarQ8VBT3 265 aa25.02■■□□□ 1.6
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Zeb2Q9R0G7 1215 aa25.02■■□□□ 1.6
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Dennd6aQ8BH65 605 aa25.01■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ubap1lG3UW59 384 aa25■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Pm20d1Q8C165 503 aa25■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa25■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa24.99■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Slx1bQ8BX32 270 aa24.99■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Card10P58660 1021 aa24.98■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Kcnh5Q920E3 988 aa24.98■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Amotl2Q8K371 772 aa24.96■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Nlgn1Q99K10 843 aa24.96■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Fer1l6E0CZ42 1862 aa24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Cabp4Q8VHC5 271 aa24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Dnajc10Q9DC23 793 aa24.93■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Fmnl2A2APV2 1086 aa24.92■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Taok3Q8BYC6 898 aa24.92■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 TatQ8QZR1 454 aa24.91■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Astn2Q80Z10 1352 aa24.91■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 TnrQ8BYI9 1358 aa24.91■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ly75Q60767 1723 aa24.87■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa24.87■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Mast2Q60592 1734 aa24.86■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa24.85■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Slc24a1Q91WD8 1130 aa24.85■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Kat6bQ8BRB7 1872 aa24.84■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 RgmbQ7TQ33 436 aa24.83■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Slc4a1apE9PX68 744 aa24.79■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa24.79■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Pak3Q61036 559 aa24.79■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ano8Q6PB70 1060 aa24.79■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 CemipQ8BI06 1361 aa24.78■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ubr1O70481 1757 aa24.77■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 FancaQ9JL70 1439 aa24.77■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Akap11E9Q777 1895 aa24.77■■□□□ 1.56
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Vps33bP59016 617 aa24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tmem132eQ6IEE6 982 aa24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Mdc1Q5PSV9 1707 aa24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 CrklP47941 303 aa24.73■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ankrd23Q812A3 306 aa24.73■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 OptnQ8K3K8 584 aa24.72■■□□□ 1.55
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Nwd2Q6P5U7 1742 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.3 ms