RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	GABRD	O14764	452 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KRT36	O76013	467 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CNTF	P26441	200 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DAOA	P59103	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	NUP205	Q92621	2012 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CERS2	Q96G23	380 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	HAS3	O00219	553 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	LRPAP1	P30533	357 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PGM1	P36871	562 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RCN1	Q15293	331 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC6	Q16204	474 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	BIRC5	O15392	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PLIN3	O60664	434 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GLRA3	O75311	464 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SLC1A6	P48664	564 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SCNN1G	P51170	649 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PGGT1B	P53609	377 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MXRA7	P84157	204 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MBLAC2	Q68D91	279 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CYS1	Q717R9	158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RNF34	Q969K3	372 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF778	Q96MU6	729 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CAPN14	A8MX76	684 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	LTF	P02788	710 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TH	P07101	528 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PCLAF	Q15004	111 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DLG2	Q15700	870 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MORN1	Q5T089	497 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SAT1	P21673	171 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SNX15	Q9NRS6	342 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MEI4	A8MW99	385 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GP5	P40197	560 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CCNJL	Q8IV13	435 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.4	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms