RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 HMGB4Q8WW32 186 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 GAB3Q8WWW8 586 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 TTC17Q96AE7 1141 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 DEF6Q9H4E7 631 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 RAD54BQ9Y620 910 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 CKAP5Q14008 2032 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQF6 199 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 ST8SIA6P61647 398 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 ARID5BQ14865 1188 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 NTAN1Q96AB6 310 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 C11orf74Q86VG3 221 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 SUN2Q9UH99 717 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 ECT2LQ008S8 904 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 SLC18A3Q16572 532 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 KDM1BQ8NB78 822 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.58■■□□□ 1.21
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